郑田利 作品数:11 被引量:73 H指数:5 供职机构: 四川大学华西公共卫生学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技重大专项 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
2011-2013年成都地区腹泻患儿鼻病毒监测资料分析 2015年 目的了解2011-2013年成都地区腹泻患儿中鼻病毒(Human Rhinovirus,HRV)检出率、型别分布以及VP4/VP2基因特征。方法应用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)对2011年1月-2013年12月从693例腹泻患儿病例粪便标本提取的病毒核酸进行HRV-5'NCR筛检,筛检阳性标本扩增HRV-VP4/VP2基因并对阳性扩增产物测序,通过序列的比对分析鉴定病毒型别及同源性。结果 693份腹泻患儿粪便标本中HRV核酸检出率为9.24%(64/693)。获得VP4/VP2有效序列31条,HRV-A型18例,HRV-B型4例,HRV-C型9例。结论成都地区腹泻患儿粪便样本中鼻病毒检出率较高,不同基因型均有检出并且以HRV-A亚型为主。 董泽丰 郑田利 陈凡 周涛 王溯源 胡鹏威 裴晓方关键词:鼻病毒 腹泻 逆转录聚合酶链反应 2011年-2012年安徽省B型流感病毒HA基因特性分析 2014年 目的分析2011年-2012年安徽省B型流感病毒流行病学特点及血凝素基因变异情况。方法收集安徽省2011年-2012年B型流感阳性标本,病毒分离培养后选取16株对其HA基因扩增并测序。结果 14株Victoria系与2009年-2012年北半球疫苗株B/Brisbane/60/2008相比,核苷酸同源性在98.5%-99.5%之间,氨基酸同源性在95.4%-99.3%之间;2株Yamagata系与疫苗株B/Wisconsin/01/2010相比,核苷酸同源性为99.3%,氨基酸同源性为99.3%,仅有1个-4个抗原位点发生变化,未出现新的变异株。结论 2011年-2012年安徽省以B型Victoria系为流行株,未发现明显变异,WHO推荐的疫苗株B/Brisbane/60/2008起到积极的预防作用。 何军 郑田利关键词:B型流感病毒 测序分析 成都地区2009—2013年儿童人博卡病毒感染分析 被引量:2 2016年 目的了解四川成都地区急性呼吸道感染住院患儿人博卡病毒(HBoV)的感染情况,分析其流行特征。方法采集2009年10月q013年10月年成都市某妇女儿童医院因呼吸道感染而住院的患儿鼻咽抽提物,提取核酸,用巢式PCR方法检测人博卡病毒;同时对流感病毒等其他7种呼吸道病毒进行检测,了解混合感染情况;用统计学软件对检测结果及病例信息进行分析。结果在1842份标本中,HBoV检出率为6.84%(126/1842),与其他呼吸道病毒混合感染率为58.73%(74/126);患儿以下呼吸道感染为主,1—2岁检出率最高,为7.83%(108/1379);HBoV感染未见明显的季节性分布特点。结论HBoV为成都地区儿童发热呼吸道症候群的主要病原之一,〉2岁儿童检出率最高,且与其他病毒有较高的混合感染率。 郑田利 董泽丰 周玲旭 程悦 凌莉 许欣 裴晓方关键词:人博卡病毒 急性呼吸道感染 PulseNetChina数据库在安徽省4起霍乱疫情溯源中的应用 被引量:2 2013年 目的通过PulseNetChina数据库对安徽省2012年4起霍乱疫情进行溯源分析。方法应用PCR扩增霍乱弧菌CT和TCP毒力基因,并利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对其进行分型,使用BioNumericsV4.0软件对电泳结果进行聚类分析,并与PulseNetChina数据库进行比对。结果16株菌经PCR扩增,CT和TCP基因均出现目的条带。菌株经NotI和踊I酶切,PFGE聚类分析显示,13株菌的同源性〉98%。其中2株菌与PulseNetChina数据库中湖南、四川、浙江、上海、湖北5省(市)同年霍乱疫情菌株同源性达100%。结论安徽省2012年4起霍乱疫情均源自食用霍乱弧菌感染甲鱼。PulseNetChina数据库能有效、快速地对霍乱疫情溯源和预警。 胡守奎 郑田利 胡万富 王建军 李伟 崔志刚 周海健 逄波 阚飙关键词:霍乱 2011—2013年成都地区发热呼吸道症候群住院患儿鼻病毒流行病学特征 被引量:18 2016年 目的:监测分析2011—2013年成都地区发热呼吸道症候群住院患儿鼻病毒(HRV)检出情况、病原型别及流行特征,为本地区HRV感染防控提供基础数据。方法:应用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)对2011年1月—2013年12月从1 117例患儿鼻咽抽吸物标本提取的病毒核酸进行HRV-5′NCR筛检,随机挑取30例筛检阳性标本扩增HRV-VP4/VP2基因并测序,通过序列的比对分析鉴定病毒型别及变异状况。结果:1 117份鼻咽抽吸物标本中HRV-5′NCR核酸检出率为24.62%(275/1 117)。测序获得的30条HRVVP4/VP2中,HRV-A型15例,HRV-B型4例,HRV-C型11例。检出高峰在11月,1岁以内儿童检出率最高;不同临床诊断疾病中,伴有喘息性疾病的患儿中HRV检出率最高。结论:HRV是成都地区呼吸症候群住院患儿病毒性感染的常见病原,HRV感染在成都地区全年均可发生,不同季节和年龄组检出率不同,呈现多个基因型共同流行且以A型为主的特点。 董泽丰 郑田利 范雪佳 裴晓方关键词:鼻病毒 逆转录聚合酶链反应 急性呼吸道感染患儿中不同基因型人鼻病毒感染研究 被引量:12 2016年 目的了解急性呼吸道感染住院患儿中不同基因型人鼻病毒(Human Rhinovirus,HRV)流行情况,并进行遗传变异分析。方法采集2010年1月至2014年2月年成都某妇女儿童医院因急性呼吸道感染住院患儿的鼻咽抽提物1780份,采用巢式PCR方法,先用HRV-5'NCR引物筛检标本,了解该病毒总检出率,阳性标本再用HRV-VP4/VP2引物进行分型检测,利用MEGA6.06软件分析其变异情况。结果在1 780份鼻咽抽吸物标本中,HRV阳性为365例(20.5%,365/1 780),其中244份VP4/VP2基因阳性,经序列分析发现132例为A型、30例为B型、82例为C型;不同基因型的检出率在月份和年龄上有一定波动,其中A型和C型呈交互流行特点;经同源性分析发现不同基因型内和型间的核苷酸同源性差异较大。结论 HRV是成都地区急性呼吸道感染较为常见的病原之一,以HRV-A型和C型流行为主,各个基因型间具有较高的变异性。 郑田利 李树华 吴舒 谢林伸 周涛 刘涛 左浩江 裴晓方关键词:急性呼吸道感染 基因型 花椒提取物对致痤疮菌的抑菌活性研究及机制初探 被引量:14 2017年 目的研究花椒提取物对致痤疮菌的体外抑菌活性,并初探其抑菌机制。方法以水蒸气蒸馏法提取花椒精油,热浸提法提取花椒水提物,采用纸片扩散法和96孔板微量肉汤稀释法,分别测定和比较2种花椒提取物对痤疮丙酸杆菌、表皮葡萄球菌、金黄色葡萄球菌的体外抑菌效果。选取抑菌效果好的提取物,以痤疮丙酸杆菌、金黄色葡萄球菌为受试对象,运用化学法探讨其对细菌胞壁通透性的影响。结果花椒精油对痤疮丙酸杆菌、表皮葡萄球菌、金黄色葡萄球菌的MIC分别为5mg/ml、16.7mg/ml、10mg/ml,花椒水提物对痤疮丙酸杆菌、表皮葡萄球菌、金黄色葡萄球菌的MIC均大于100mg/ml,花椒精油对3种致痤疮菌的抑菌效果优于水提物。MIC、2MIC浓度的花椒精油作用于痤疮丙酸杆菌、金黄色葡萄球菌可引起细菌细胞内K^+、Mg^(2+)、AKP等物质渗漏至胞外,抑制细菌生长。结论花椒精油对3种致痤疮菌均有明显的抑菌作用,抑菌效果优于花椒水提物,其抑菌机制可能是增加了细菌胞壁通透性,引起胞内物质外漏所致。 王瑶 陈宇航 庞雯文 陈嘉熠 郑田利 周涛 裴晓方关键词:抑菌活性 肠道常见菌群荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:15 2014年 目的分别建立检测部分肠道常见菌群的荧光定量PCR方法,为肠道菌群及其相关疾病的研究提供快速、敏感、准确的检测手段。方法根据肠道细菌16S r RNA基因序列,选择针对不同肠道细菌的特异性引物,建立并优化荧光定量PCR检测方法,并对建立的方法进行特异性及重复性实验。采用基因重组技术,构建肠道常见菌群目的基因的重组质粒,作为PCR检测定量参考。结果成功建立了检测大肠埃希菌、肠球菌、乳杆菌、双歧杆菌、产气荚膜梭菌、拟杆菌、拟杆菌门菌、硬壁菌门菌以及肠道菌群总量的荧光定量PCR方法。方法特异性试验结果表明,反应体系与待测菌以外的其他细菌无交叉反应。重复试验结果显示,各待测菌8次重复试验的变异系数均小于2%。各待测菌标准曲线的相关系数r≥0.994,线性关系良好。结论本研究建立的Eva Green荧光定量PCR检测方法可以特异的从粪便中检出部分肠道常见菌群,且方法重复性好,是快速、敏感、准确地检测肠道菌群的有利手段。 程悦 左浩江 廖虹瑜 陈嘉熠 郑田利 裴晓方 许欣关键词:荧光定量PCR 肠道菌群 成都地区376例尘肺住院患者呼吸道感染病原谱研究 被引量:7 2021年 目的了解尘肺患者呼吸道病原体感染情况,季节、年龄和不同尘肺分期的病原体感染规律,探究尘肺患者呼吸道感染病原谱。方法采集2017年1月-2019年10月成都市某职业病医院376例尘肺住院患者痰液并收集患者临床信息,检测痰液中23种常见病毒、细菌及真菌,分析季节、年龄和不同尘肺分期与病原体检出率间的关系。结果376份痰液标本中病原体检出率为42.29%(159/376),病毒检出率为32.98%(124/376),细菌检出率为9.57%(36/376),真菌检出率为6.12%(23/376)。检出率最高的6种病原体依次为副流感病毒、鼻病毒、流感病毒、白色念珠菌、肺炎克雷伯菌和克柔念珠菌。不同季节、年龄和尘肺分期与呼吸道感染严重程度的差异无统计学意义。结论成都地区尘肺患者呼吸道感染病原谱复杂,病毒感染占比高,但感染严重程度与年龄、季节、尘肺分期无关。 范紫玮 李晶晶 李树华 吴舒 郑田利 裴晓方关键词:尘肺病 呼吸道病原体 副流感病毒 白色念珠菌 成都市售辣椒中产黄曲霉毒素菌株的分离及其基因分析 被引量:1 2015年 目的从成都市售辣椒粉中,分离产黄曲霉毒素的菌株,探究产毒基因aflR、omt-1和ver-1与产黄曲霉毒素B1(AFB1)能力的关系。方法采用传统培养法分离菌株,多重PCR方法筛查潜在产黄曲霉毒素菌株,对潜在产黄曲霉毒素菌株进行产毒培养,以ELISA方法检测潜在产毒株7d产毒培养液中AFB1含量;同时基于潜在产毒株的产毒关键基因aflR、omt-1和ver-1构建系统进化树,分析其同源性。结果 64份辣椒样品中,分离到17株潜在产AFB1的黄曲霉菌株,有11株分离株产毒,产毒黄曲霉分离率为64.71%;且基于aflR、omt-1和ver-1基因与产毒标准菌株有较高同源性;有6株分离株不产毒,与米曲霉序列有较高同源性。结论控制黄曲霉污染是黄曲霉控制中重要的环节之一。并非含有产毒基因的黄曲霉都会产AFB1毒素,产AFB1能力与产毒基因aflR的序列有着直接联系,而AFB1合成量的高低与omt-1和ver-1基因有关。 凌莉 叶正茂 王溯源 金燕 陈宇航 郑田利 张立实 裴晓方关键词:黄曲霉毒素B1 黄曲霉 辣椒粉 同源性分析