施勇
- 作品数：96 被引量：291H指数：7
- 供职机构：江西省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：江西省卫生厅科技计划项目江西省卫生厅基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 2009年江西省新分离流行性乙型脑炎病毒株全基因组分子生物学特性研究被引量：3
- 2010年
- 目的对2009年分离自江西省蚊虫标本的流行性乙型脑炎(乙脑)病毒JX0939株进行全基因组序列测定,分析其基因组特征。方法使用针对乙脑病毒全基因组测序引物进行PCR扩增基因组片段,PCR产物直接测序,拼接后获得全基因组序列。利用生物信息学软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析。结果新分离乙脑病毒JX0939株基因组全长10965个核苷酸,从97位到10392位,共10296个核苷酸编码一个开放阅读框,编码3432个氨基酸。与GenBank中登录的所有59株乙脑病毒全基因组序列比较发现,其核苷酸总体差异率为1%～17%,氨基酸总体差异率为0.1～5%。与目前使用的减毒活疫苗株SA-14-14-2株相比较,只有88%的核苷酸同源性,全基因组共存在1237个核苷酸差异,83个氨基酸差异。提取GenBank登录的及本实验室测定的不同省份的乙脑病毒全基因组序列,进行全基因组序列系统进化分析显示JX0939株属于基因1型乙脑病毒。结论新分离的乙脑病毒JX0939株属于基因1型,与2007年中国分离株SH17M-07进化关系最接近,与疫苗株SA-14-14-2相比关键位点氨基酸未见变异。
- 王力华李铭华付士红姜红月陈维欣唐松戴新平应彩霞詹漫华施勇梁国栋
- 关键词：乙型脑炎病毒全基因组系统进化分析
- PCR—RFLP方法快速鉴别水痘-带状疱疹病毒野病毒与疫苗株
- 2016年
- 目的PCR—RFLP的方法快速鉴别2010-2015在江西省采集的水痘-带状疱疹标本中的野病毒与疫苗株。方法选取2010-2015年在江西省南昌市采集的的水痘-带状疱疹感染临床诊断病例的疱疹液和咽拭子标本共112份，分别使用特定引物对水痘一带状疱疹病毒（VZV）ORF62区、ORF38区和ORF54区进行扩增，对阳性扩增产物分别使用限制性内切酶SmaI、PstI及BglI进行酶切，对酶切产物进行片段长度多态性分析。结果112份标本中，39份标本的病毒核酸经特定区域的PCR扩增后，对产物进行酶切结果为SmaI-、PstI＋及BglI＋，而疫苗株酶切的结果为SmaI＋、PstI-及BglI＋。结论PCR—RFLP方法可以快速鉴定VZV的野毒株与疫苗株，江西省2010—2015年采集的水痘一带状疱疹标本中的VZV均为野病毒。
- 周珺龚甜熊英施勇
- 关键词：水痘-带状疱疹病毒野毒株疫苗株
- 2008-2012年江西省甲型H3N2流感病毒HA1基因特征及与疫苗株差异分析被引量：4
- 2015年
- 目的掌握2008-2012年江西省甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因特征,在分子水平了解WHO甲3型疫苗推荐株对江西省甲3亚型流感病毒预防效果。方法采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的甲3型流感病毒毒株进行核酸的提取,扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定并对HA1基因特性进行分析。结果 2008-2012年共分离到甲3型流感病毒553株,对其中23株毒株进行HA1基因序列测定,各年份的毒株HA1序列分别与当年WHO对北半球推荐的疫苗株进行比对,结果为2008-2012年氨基酸同源性分别为98.4%～99.1%、96.6%～98.4%、97.2%～98.4%、96.2%～97.2%和96.6%～98.1%;抗原决定簇区氨基酸平均变异数分别为1.3个、3.2个、1.4个、3个和2.5个;其中2009年有3株在2个抗原决定簇区发生了4～5个的氨基酸替换。结论2008-2012年甲型H3N2亚型流感病毒分离株HA1基因在不断发生变异,疫苗对我省2008年度、2010年度和2012年度的甲型H3N2亚型流感保护效果良好,在2011年度保护效果存在滞后现象,对2009年甲型H3N2亚型流感保护效果较差。
- 龚甜熊英李健雄施勇周珺徐刚
- 关键词：疫苗株基因
- 南昌市2010年初不同人群肠道病毒71型血清流行病学调查被引量：6
- 2013年
- 目的了解2010年初江西省南昌市人群人肠道病毒71型(Human Enterovirus71,HEV71)抗体水平,为预防控制手足口病(Hand-foot-mouth Disease,HFMD)在人群中的流行提供依据。方法选择江西省甲型H1N1流感感染状况快速血清学调查的1144份血清标本,采用中和试验检测血清HEV71中和抗体,并对检测结果进行统计学分析。结果 HEV71中和抗体阳性率为74.74%(855/1144),2岁～组儿童抗体阳性率最低,随着年龄的增长,抗体阳性率升高,3岁以下儿童中和抗体阳性率仅为52.01%;HEV71中和抗体阳性标本的几何平均滴度为1︰22.34,以0岁～组GMT最低,3岁～组达到高峰,之后呈下降趋势;不同月龄婴儿HEV71中和抗体阳性率0～月龄最高,之后逐月下降,至4～月龄组阳性率最低,之后开始升高,EV71阳性标本中和抗体几何平均滴度0～月龄组GMT与1～月龄组基本持平,之后逐月下降,5～月龄组最低,6～月龄组急剧升高;在HEV71中和抗体阳性人群中,各年龄组中中和抗体滴度1︰8～1︰32构成比均为显著高于其他滴度组构成比(P﹤0.05),滴度≥1︰256的标本从6～月龄组开始,各年龄组均有出现。结论南昌市人群HEV71中和抗体水平较高,各年龄组人群近期均有感染,3岁以下儿童是HEV71感染引起HFMD流行的最易感人群,学龄前儿童是HFMD流行防控的重点,成人也应预防HEV71的感染;胎儿具有母传抗体,但抗体水平降低较快。
- 熊英龚甜施勇周珺刘丽萍曾艳文刘师文肖芳
- 关键词：人肠道病毒71型中和抗体血清流行病学调查
- 江西省2009年至2012年甲型H3N2流感病毒耐药性分析被引量：6
- 2014年
- 目的分析江西省2009-2012年甲型H3N2流感病毒M2以及NA基因的特点,掌握其耐药情况,为临床治疗和疾病控制提供参考。方法从江西省流感监测网中随机选择19株甲型H3N2流感病毒,经核酸提取和one-step RT-PCR扩增M以及NA基因片段,双向序列测定,采用DNAStar5.0和Mage4.0序列分析软件分析M2以及NA基因特征以及耐药性位点。结果 19株毒株M2基因31位氨基酸均由丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N);所有毒株NA蛋白催化活性位点和辅助位点均未发生氨基酸替换。结论 19株毒株均对金刚烷胺类药物耐药,对流感病毒神经氨酸酶抑制剂药物均敏感,但仍应加强对流感病毒的耐药性监测。
- 李健雄熊英施勇龚甜周珺徐刚
- 关键词：M2耐药性
- 南康市2007年一起麻疹暴发的分子生物学研究被引量：5
- 2009年
- [目的]分析南康市麻疹暴发的分子生物学特征,掌握麻疹病毒的基因特性。[方法]采用Vero/SLAM细胞对2007年暴发疫情患者咽拭子标本进行麻疹病毒分离,通过RT-PCR方法扩增麻疹病毒分离株核蛋白(nucleopro-tein,N)基因,并对扩增出的核苷酸序列进行测定和分析。[结果]2007年南康市麻疹病毒分离株为麻疹H1基因型,属于我国麻疹病毒的优势株。两株分离株之间N基因氨基酸的同源性为98.7%;与中国疫苗株沪191株的N基因氨基酸序列比较,其同源性分别为94.7%和96.0%。[结论]南康市此次麻疹暴发疫情病毒分离株为H1基因型,并与中国疫苗株沪191株在基因特性上有明显差异。
- 龚甜周顺德熊英周珺施勇
- 关键词：麻疹病毒核蛋白麻疹暴发
- rRT-PCR法在脊髓灰质炎病毒型内鉴定中的应用被引量：1
- 2015年
- 目的应用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(rRT-PCR)对脊髓灰质炎病毒(PV)进行型内鉴定,并对该方法进行评估。方法采用世界卫生组织(WHO)推荐的脊髓灰质炎ITD和VDPV rRT-PCR方法对江西省既往分离的14株脊髓灰质炎毒株和2013年分离的15株脊髓灰质炎毒株进行ITD和VDPVs筛选,并将检测结果与毒株的VP1编码区核苷酸序列测定结果进行比较分析。结果 ITD rRT-PCR的实验结果除1株毒株漏检外,其余与毒株的VP1编码区序列测定结果完全相符,VDPV rRT-PCR的结果与VP1编码区序列测定结果不完全相符,共有14株Ⅱ型脊髓灰质炎病毒疫苗类似株被错判为VDPV株,11株Ⅲ型VDPV株错判为疫苗类似株。结论对脊髓灰质炎型内进行rRTPCR鉴定的方法可以替代中和试验的常规检测方法,但不能完全取代测序技术用于脊髓灰质炎VDPV的鉴定。
- 李建雄熊英施勇刘师文刘晓庆肖芳
- 关键词：实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应脊髓灰质炎病毒
- 2012-2015年江西省啮齿动物间流行的汉坦病毒基因型和基因亚型分析被引量：5
- 2018年
- 目的了解2012-2015年江西省啮齿动物间流行的汉坦病毒基因型别和基因亚型。方法选取江西省肾综合征出血热疫情发生地区捕鼠,收集鼠肺标本,采用直接免疫荧光法检测鼠肺中汉坦病毒抗原,提取阳性鼠肺标本核酸,设计并采用特异性引物分别对病毒的S、M、L 3个基因进行RT-PCR扩增,对扩增产物测序和分析。结果共捕鼠2 235只,其中汉坦病毒阳性的86只,阳性率3.85%,流行的HV基因型为汉滩型(Hantaan orthohantavirus,HTNV)和汉城型(Seoul orthohantavirus,SEOV)。江西省HTNV之间S、M、L 3个基因核苷酸的同源性为93.4%~100%,与国内外HTNV参考株3个基因核苷酸的同源性为77.3%~88.0%,在3个基因系统进化树上均呈独立分支;M基因系统进化分析发现江西省SEOV分布在S3、S4亚型分支以及1个独立的进化分支,该独立分支的9株SEOV与国内外SEOV M基因核苷酸同源性仅为84.3%~88.7%。结论江西省啮齿动物流行的HV为HTNV和SEOV 2种基因型别,其中HTNV为新的基因亚型,SEOV存在3个基因亚型:S3、S4和1个新的基因亚型。
- 刘师文徐刚龚甜施勇李健雄刘晓庆肖芳张艳妮周珺熊英
- 关键词：汉坦病毒基因分型基因亚型
- 新型冠状病毒Alpha变异株实验室检测研究
- 2022年
- 目的对一例新冠肺炎境外输入病例进行实验室检测,并对新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)变异株进行鉴定,了解不同样本类型中新冠病毒的检出情况。方法采集咽拭子、痰液、粪便、尿液和血液多种类型样本共13份,分别提取核酸,用荧光RT-PCR法检测SARS-CoV-2。使用纳米孔MinION Mk1C测序仪,对阳性咽拭子样本进行实时SARS-CoV-2靶向扩增全基因组测序,运用artic-ncov2019、DNAstar和Mega等软件对测定序列进行处理和分析。结果咽拭子、痰液、粪便、血浆和尿沉渣样本中均检出SARS-CoV-2核酸,咽拭子和血浆样本在发病的前四天均能检出,尿沉渣样本在发病当天能检出。基于纳米孔测序技术,7 h即获得SARS-CoV-2全基因组数据,经分析显示为新冠病毒Alpha变异株。结论本例境外输入新冠肺炎确诊病例的病原为SARS-CoV-2 Alpha变异株,咽拭子、血浆样本和尿沉渣样本在发病早期均能检出SARS-CoV-2核酸。
- 龚甜余福平李健雄施勇刘师文肖芳熊火梅肖大瑾刘晓庆张艳妮徐刚周珺冉鑫王倩熊英
- 关键词：新型冠状病毒尿沉渣
- 2013-2016年江西省麻疹病毒分离株H基因特征分析
- 2021年
- 目的探究江西省2013-2016年麻疹病毒的流行特点与流行趋势。方法用Vero/SLAM细胞对麻疹病毒进行分离培养,对获得的麻疹毒株扩增其H基因序列,并对获得的基因片段进行核苷酸序列的测定,再与Gengbank上麻疹各基因型别的参考序列进行比对,分析其亲缘关系、同源性等变异情况。结果2013-2016年获得75株麻疹毒株,均为H1a基因型。75个毒株H基因之间的核苷酸同源性为97.86%~100%,与疫苗株Shanghai-191 H基因的核苷酸同源94.23%~94.71%,与H1a基因型代表株CHN/93/2(AF045196)H基因的核苷酸同源性为98.41%~99.02%;进化树显示,2013-2014年出现过11株小的分支流行但很快消失了。结论目前江西省麻疹病毒优势流行株的基因型别为H1a基因型。
- 张艳妮龚甜李健雄施勇徐刚
- 关键词：麻疹病毒基因型
