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2025年9月12日星期五

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2011-2016年昆明市手足口病病原学特征分析被引量：16: 2019年; 目的阐明2011-2016年昆明市手足口病病原学特征,为手足口病防控提供参考依据。方法收集2011年1月-2016年12月昆明市手足口病临床诊断病例标本,使用实时定量荧光PCR(real-time PCR)方法检测手足口病病毒核酸。用SPSS 20.0软件分析计数结果。结果2011-2016年检测粪便、肛拭子及咽拭子等标本共计6373份,其中人肠道病毒通用型(human enterovirus universal, EV-U)阳性4679份,阳性率73.42%。昆明市手足口病病原由肠道病毒71型(enterovirus A71, EV-A71)、柯萨奇A组16型(coxsackievirus A16, CV-A16)及其他肠道病毒组成,其优势病原不断变化,2011-2016年优势病原依次为EV-A71型、CV-A16型、其他肠道病毒、CV-A16型、其他肠道病毒、CV-A16型;病原构成差异有统计学意义(χ^2=967.591,P<0.001)。粪便标本阳性率(81.84%)较肛拭子(60.65%)及咽拭子(32.40%)高(χ^2=836.895,P<0.001),重症手足口病标本的EV-A71型检出最多,占重症阳性标本的50.53%(431/853)。发病高峰在 4-7月,占病例标本总数的53.68%(3 421/6 373),由单峰分布演变为双峰变化。主城区的官渡、西山、五华、盘龙病例较多,不同地区手足口病病例标本的阳性率差异有统计学意义(χ^2=1 090.546,P<0.001)。发病年龄集中在6岁以下,其中1~3岁年龄段的病例最多;男、女发病比例为1.46∶1,男女病原构成比差异无统计学意义(χ^2=3.367,P=0.186)。结论昆明市手足口病呈现明显季节性、年龄特征及一定的地区分布规律;病原以EV-A71型和CV-A16型为主,其他肠道病毒的构成比逐渐上升;EV-A71型是引起重症病例的主要病原,应重点防控。; 李文龙刘艳艳简千棋马丽波刘如锦侯敏李旭; 关键词：手足口病 REAL-TIME PCR 肠道病毒病原学监测

昆明市2009-2012 年流感监测结果分析被引量：5: 2014年; 目的了解昆明市2009-2012年的流感流行趋势,为流感防控提供科学依据。方法采集流感样病例(ILI)的咽拭子标本,用狗肾传代细胞(MDCK)分离病毒或采用荧光定量PCR方法进行核酸检测,对流感病毒进行型别鉴定。结果监测2 900份流感样标本中,阳性780份,A型检出715份,B型检出65份。A型流感病毒中甲型H1N1检出578份,H3型74份,A未分型61份,H1型2份。各年龄段均易感,30岁以下患者占总阳性数的79.10%。结论甲型H1N1是2009-2011年昆明市的优势流行株,与A(H3)、B型在2009-2012年不同的月份以不同强度同时或交替流行,30岁以下年龄是流感防控的重点人群。; 张烜榕颜军李文龙简千棋李桂满蒋玉佳侯敏; 关键词：流感病毒流感监测

一种病毒冷藏转运装置: 一种病毒冷藏转运装置，包括转运箱；密封盖，所述密封盖铰接安装在所述转运箱的顶部；连接杆，所述连接杆设置在所述密封盖上；螺纹安装块，所述螺纹安装块固定安装在所述连接杆的底端；螺纹凹槽，所述螺纹凹槽开设在所述转运箱的顶部；横...; 简千棋李文龙马丽波朱心杨瑶刘如锦刘艳艳; 文献传递

2014-2018年昆明市重症手足口病病原柯萨奇病毒A6型的流行与遗传变异特点被引量：12: 2021年; 目的了解2014-2018年昆明市重症手足口病患者感染的柯萨奇病毒A6(Coxsackievirus A6,CV-A6)型流行情况及其全长VP1区基因特征。方法收集2014-2018年昆明市重症手足口病病例资料及标本1064份,采用Real Time RT-PCR方法进行肠道病毒核酸检测,分析其流行特征。利用随机数表随机选取63例重症CV-A6阳性标本,对其进行完整VP1区基因序列测定,使用Mega6.0软件进行序列分析并构建系统进化树,并比较其核苷酸、氨基酸同源性及氨基酸变异情况。结果2014-2018年昆明市重症手足口病例中共检出肠道病毒阳性标本666份,其中CV-A6阳性195份。5年中重症手足口病例报告数呈下降趋势,但每年均有重症CV-A6病例报告,发病高峰期在4~7月,呈单峰模式,6月达最高峰。感染病例中男女性别比为2.55∶1,≤2岁儿童居多(73.33%),且重点集中在官渡和西山两区。63个CV-A6毒株均位于D3基因亚型D3a进化分支,与国内多地区CV-A6处于共循环状态。该分支分为3个进化小分支,D3a.1包含2014-2016年的所有毒株及少量2017年、2018年毒株;D3a.2包含绝大多数2017年及2018年毒株,D3a.3只有1株2014年昆明株。VP1区氨基酸在多个位点上与原型株存在特异突变,氨基酸变异已呈现年度间规律性。结论CV-A6是引起昆明市重症手足口病主要抗原之一,持续开展CV-A6分子流行病学检测,对昆明市手足口病的防控具有重要意义。; 刘艳艳向以斌李文龙简千棋马丽波刘如锦杨瑶朱心侯敏; 关键词：重症手足口病流行病学

2014-2015年昆明市175件市售海产品中诺如病毒污染状况检测被引量：5: 2016年; 目的调查昆明市售海产品中诺如病毒的污染状况,为市民消费海产品提供建议,为昆明市售海产品食用安全性提供依据。方法 2014年7月至2015年7月,采集市售海产品175件,应用real-time RT-PCR法分别检测诺如病毒的GⅠ和GⅡ两个亚型,并对不同类型、不同季节、不同产地市售海产品中诺如病毒的污染情况进行比较。结果175份市售海产品中诺如病毒总检出率为1.14%(2/175),从基因分型看,2份阳性样品均为GⅡ型。结论 2014年-2015年昆明市售海产品中检出GⅡ型诺如病毒,存在通过食用海产品感染的风险。; 李文龙李桂满颜军张烜榕简千棋侯敏; 关键词：诺如病毒 REAL-TIME RT-PCR 污染状况基因分型

单核细胞增生李斯特菌三种检测方法的比较被引量：3: 2013年; 目的：通过比较国标法、real—timePcR法和LAMP方法，得到适合基层实验室快速检测单核细胞增生李斯特菌的方法。方法：分别用国标法、real-timePcR法和环介导的等温扩增（100p—mediated isothermal amplification，LAMP）法检测李斯特菌，并进行方法比较。结果：三种方法对单增李斯特菌的检测结果一致．国标法整个检测过程需5～7d；real—timePCR法实验条件要求高，成本高，检测需1．5～2．5d；LAMP法实验条件低，成本低，检测时限与real—timePCR相同。结论：LAMP~检测单增李斯特菌灵敏度高、特异性强、快速高效和低成本，适合基层实验室应急检测和现场监测使用。; 张烜榕颜军李文龙侯敏蒋玉佳卜舒李桂满; 关键词：国标法 LAMP PCR

2021年昆明市手足口病流行病学和肠道病毒病原谱特征被引量：6: 2023年; 目的了解昆明市手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)流行病学和肠道病毒(Enterovirus,EV)病原谱特征。方法通过中国传染病报告信息管理系统收集2021年昆明市HFMD病例信息进行描述性流行病学分析;采集部分HFMD病例标本,采用荧光定量PCR检测肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)、柯萨奇病毒A16型(Coxsackievirus A16,CVA16)、CVA6和其他EV,采用一步法RT-PCR对其他EV进行扩增和基因型鉴定;构建各基因型EV与参考株的VP1区全基因序列系统进化树,分析亲缘性。结果2021年昆明市HFMD报告发病率为103.72/10万(8804例),其中0-4岁、5-9岁、10-14岁、≥15岁分别为8724.75/10万、1649.25/10万、29.08/10万、9.35/10万,主城区、郊县分别为524.10/10万、965.68/10万。HFMD病例标本的EV检测阳性率为63.15%(538/852);在538株EV中,CVA16、CVA6、EV71、CVA4、CVA2、CVA10、埃可病毒18型(Echovirus 18,E18)、CVA9、E30、CVA5、CVA12、E21、未分型EV分别占38.66%(208株)、30.86%(166株)、2.97%(16株)、2.97%(16株)、1.30%(7株)、1.12%(6株)、0.74%(4株)、0.37%(2株)、0.37%(2株)、0.19%(1株)、0.19%(1株)、0.19%(1株)、20.07%(108株)。CVA16、CVA6、EV71和CVA4的优势亚型分别为B1a、D3a、C4a和C2亚型,其中CVA16 B1a亚型、EV71与东南亚国家流行株的亲缘关系密切,CVA6、CVA4与中国其他地区流行株的亲缘关系密切。结论2021年昆明市<5岁儿童和郊县HFMD发病率高;HFMD的EV病原谱呈多样性,优势基因型从既往的EV71转变为CVA16、CVA6和CVA4。; 刘艳艳姜黎黎李文龙简千棋马丽波刘如锦杨瑶朱心伏晓庆侯敏; 关键词：手足口病流行病学病原谱基因特征

云南省2例人感染欧亚类禽H1N1猪流感病毒分子特征分析被引量：2: 2022年; 目的回顾性分析云南省2例人感染欧亚类禽H1N1猪流感病毒(Eurasian avian-like H1N1 swine influenza viruses,EAH1N1 SIVs)分子特征及遗传进化特征,为流行性感冒(流感)防控提供科学依据。方法对2015年云南省流感监测网络实验室从流感样病例标本中分离到的2株EAH1N1 SIVs毒株进行全基因组测序,使用DNAStar、MEGA6.0等软件进行分子特征分析和系统进化树构建。结果云南省2015年2例人感染欧亚类禽H1N1猪流感病毒株EAH1N1 SIVs A/Yunnan-Wuhua/SWL1869/2015(H1N1)和A/Yunnan-Longyang/SWL1982/2015(H1N1)均与湖南株A/Hunan/42443/2015同源性较高,同源性分别为97.6%~99.1%和97.9%~99.4%,是EAH1N1 SIVs与A(H1N1)pdm09重配病毒,为G5基因型。受体结合位点分析表明,2株病毒结合α-2,6半乳糖苷唾液酸人受体,为低致病性流感病毒。糖基化位点分析结果显示,2株病毒在HA上有7个潜在的糖基化位点,可能影响与疫苗株抗原的匹配性。耐药性分析表明2株病毒对神经氨酸酶抑制剂药物敏感,但对烷胺类药物耐药。结论 EAH1N1 SIVs对人类健康威胁较大,加强流感监测工作,密切追踪流感病毒的变异情况,能及早发现EAH1N1 SIVs及其他致病性和传播力增强的流感病毒。; 李多李多伏晓庆罗春蕊赵晓南徐闻; 关键词：受体耐药性遗传进化分析

2014-2018年昆明市麻疹疑似病例病原学监测结果分析被引量：2: 2020年; 目的分析2014-2018年昆明市麻疹疑似病例的病原学检测结果,为进一步控制和消除麻疹提供科学依据。方法采集麻疹疑似病例病原学标本(咽拭子和/或尿液),使用Real time RT-PCR法检测麻疹病毒核酸。结果2014-2018年昆明市共报告353例麻疹疑似病例,130例实验室确诊病例,阳性率为36.83%(130/353)。其中咽拭子阳性标本127份,阳性率35.98%(127/353);尿液阳性标本48份,阳性率为30.97%(48/155)。咽拭子阳性率及尿液阳性率差异无统计学意义(χ^2=1.197,P=0.274)。2014年麻疹发病呈冬春季分布,2015-2018年演变为3-6月的单峰型;确诊病例主要分布在主城区的西山区45.38%(59/130),官渡区44.62%(58/130),五华区8.46%(11/130);男女确诊病例比为1.60∶1,确诊病例中8~23月龄组最多65例(50.00%),其次是<8月龄组32例(24.62%)、>18岁组19例(14.62%)。结论昆明市应加强麻疹重点地区和易感人群的监测,努力减少和消除免疫空白人群;进一步提高麻疹病例咽拭子标本采集质量,为努力实现消除麻疹目标提供实验室依据。; 李文龙刘艳艳马丽波刘如锦侯敏朱心简千棋; 关键词：麻疹病原学监测

2019年昆明市A型流感病毒H3N2亚型基因特征分析: 2024年; 目的分析昆明市暴发流感疫情A(H3N2)亚型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)及神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因特征,为流感防控提供科学依据。方法选取2019年1—12月昆明市暴发的7起疫情病例及哨点医院监测病例分离得到的19株A(H3N2)亚型流感毒株进行测序,采用MegAlign分析同源性,采用Jmodeltest、PhyML 3.1构建系统进化树,采用MEGA X分析突变位点。结果2019年昆明市流感暴发疫情集中在冬春季节的学校,来源于疫情和哨点医院的毒株均高度同源,同位于3C.2a1b.1b分支,与位于3C.3a1分支的2019年疫苗株A/Kansas/14/2017偏离。从疫情病例分离得到的13株毒株与从哨点医院监测病例分离得到的5株毒株分别在HA1抗原决定簇A区与B区增加T135K、S137F、K144S与S159Y、K160T突变位点,其中2株从疫情病例分离得到的毒株在抗原决定簇A区额外增加I140M突变位点,可能逃逸抗体识别,其中T135K、S137F位于130环,可能改变病毒与受体细胞的结合特性。在抗原决定簇B区增加158 NYTY糖基化位点,可能阻挡抗体识别病毒。所有分离株在NA抗原决定簇增加T329S突变位点。结论昆明市流感防控应该加强冬春季人员集中场所的监测,及时发现免疫逃逸和毒力增强的变异株,更新疫苗组分。; 简千棋马丽波朱心杨瑶刘艳艳刘如锦侯敏李文龙; 关键词：神经氨酸酶系统进化树

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