目的评估低深度全基因组测序技术(copy number variations sequencing,CNV-seq)在鼻骨发育不良胎儿遗传学病因中的诊断价值。方法选择2017年12月至2020年12月本院发现的217例鼻骨发育不良胎儿为研究对象,分为孤立型鼻骨发育不良组及合并其他异常组,进行CNV-Seq检测,并分析拷贝数变异(copy number variations,CNVs)的情况。结果在217例胎儿中共检出40例异常,异常率为18.4%,其中包括31例非整倍体(14.3%,31/217)和9例CNVs(4.1%,9/217)。孤立组共检出5例21三体(3.5%,5/144)和2例临床意义未明CNVs(1.4%,2/144)。合并组检出26例非整倍体(35.6%,26/73),包括19例21三体、6例18三体及1例13三体,另发现5例致病性CNVs(6.8%,5/73)以及2例临床意义未明CNVs(2.7%,2/73)。经卡方检验,两组差异具有统计学意义(P<0.01)。结论CNV-Seq技术对于鼻骨发育不良的胎儿的染色体异常具有较高的检出率,尤其在合并其他超声异常的病例中检出非整倍体及致病性CNVs的概率更高。
目的探讨基因组拷贝数变异测序(copy number variation-sequencing,CNV-seq)的产前诊断指征分布及异常检出情况。方法回顾性纳入2019年1月至2022年12月于郑州大学第一附属医院行产前CNV-seq的17994例孕妇。根据CNV-seq产前诊断指征分为胎儿超声异常组、无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)高风险组、唐氏综合征血清学筛查(简称唐筛)高风险组、不良孕产史组和高龄妊娠组。总结CNV-seq的产前诊断指征、异常(染色体数目异常及结构异常中的致病和可能致病性拷贝数变异)检出率及异常分布情况。采用χ^(2)检验进行统计学分析。结果17994例孕妇中胎儿超声异常、NIPT高风险、唐筛高风险、不良孕产史、高龄妊娠的比例分别为32.65%(5875/17994)、11.90%(2142/17994)、31.62%(5690/17994)、11.70%(2105/17994)和12.13%(2182/17994),异常检出率分别为10.60%(623/5875)、34.64%(742/2142)、4.69%(267/5690)、2.99%(63/2105)和3.67%(80/2182)。总体异常检出率为9.86%(1775/17994),其中染色体数目异常占68.79%(1221/1775),以21-三体为主(49.30%,602/1221);染色体结构异常占31.21%(554/1775),其中致病和可能致病性拷贝数变异分别占57.76%(320/554)和42.24%(234/554),包括416个微缺失和255个微重复。在胎儿超声异常组、NIPT高风险组和高龄妊娠组,染色体数目异常检出率均高于结构异常检出率[6.81%(400/5875)与3.80%(223/5875),χ^(2)=53.10;27.96%(599/2142)与6.68%(143/2142),χ^(2)=338.40;2.43%(53/2182)与1.24%(27/2182),χ^(2)=8.61;P值均<0.01]。微缺失中频率最高的前3位依次为Xp22.31(12.74%,53/416)、22q11.21(7.93%,33/416)和17q12(5.77%,24/416);微重复中频率最高的前3位依次为22q11.21(14.90%,38/255)、17q12(3.53%,9/255)和7q11.23(3.53%,9/255)。结论CNV-seq产前诊断指征中胎儿超声异常占比最高。CNV-seq总体异常检出率较高,尤其是以NIPT高风险为产前诊断指征者的异常检出率最高。染色体结构异常中Xp22.31微缺失和22
