目的通过网络药理学和分子对接的方法预测山茱萸抗肝损伤的作用机制。方法从多个数据库挖掘山茱萸活性成分及相关作用靶点;利用GeneCards和OMIM数据库查询与肝损伤相关靶点。通过venny获取山茱萸抗肝损伤的潜在靶点,通过R进行GO与KEGG分析,构建蛋白蛋白相互作用(PPI)网络和活性成分成分-相关靶点的可视化网络,并筛选出核心靶点。最后采用DiscoverStudio 2016分子对接进行验证。结果共查询到235个山茱萸候选成分,筛选了32种有效成分且与肝损伤相关靶标有PIK3R1、MAPK1、TP53、HSP90AA1等333个,GO与KEGG分析得到其机制与response to molecule of bacterial origin、vascular process in circulatory system、response to lipopolysaccharide等生物过程和AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications、PI3K-Akt signaling pathway等信号通路相关。分子对接结果显示山茱萸活性成分与潜在的核心靶点有良好的结合活性。结论该研究从靶点、通路、分子对接多方面验证了山茱萸抗肝损伤有着抗炎、抗氧化等潜在功效,为进一步的临床研究提供了科学依据。
目的:利用中药网络药理学和分子对接技术探讨维血宁合剂防治新型冠状病毒肺炎(COVID⁃19)的潜在活性成分及其作用机制。方法:借助TCMSP数据库检索维血宁合剂中所含的主要化学成分及其作用靶点,并与冠状病毒感染相关的靶点进行叠加分析,筛选维血宁合剂潜防治COVID⁃19的靶点;通过Cytoscape软件构建药材⁃活性成分⁃靶点网络;通过DAVID数据库对活性成分靶点进行基因本体(GO)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析;最后运用分子对接技术虚拟筛选维血宁合剂中活性成分与2019⁃nCoV S蛋白、人ACE2蛋白及2019⁃nCoV 3CL水解酶(3CLpro)的作用,预测维血宁合剂潜在的抗2019⁃nCoV成分。结果:从维血宁合剂中共梳理得到326个成分及555个相关靶点,其中101个成分对应的35个靶点与COVID⁃19密切相关;靶点通路富集分析表明,维血宁合剂主要作用于感染性疾病、炎症反应及免疫调节等过程。分子对接结果显示16个成分与S蛋白、ACE2及3CLpro均显示了较好的结合作用,成分类型主要为甾体、脂肪酸和酚类。结论:维血宁合剂可能主要通过调节机体免疫和炎症反应等,从而对COVID⁃19发挥潜在的防治作用。
