赵怀龙
- 作品数：20 被引量：65H指数：4
- 供职机构：济南市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：山东省医药卫生科技发展计划项目山东省自然科学基金深圳市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 济南市发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒基因组特征分析被引量：1
- 2022年
- 目的分析济南市发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒(Severe fever with thrombocytopenia syndrome bunyavirus,SFTSV)基因组特征。方法通过参考文献并对引物进行矫正,获得SFTSV全基因组序列。应用DNAstar 7.1、MEGA等软件对基因组序列进行基因位点、遗传进化、同源比对分析,建立L、M、S片段基因系统进化树。结果成功获得7株济南市SFTSV全基因组序列,每株分离株基因组全长均为11490 bp,其中L片段6368 bp,M片段3378 bp,S片段1744 bp。济南市SFTSV属C基因型C3分支。与湖北、河南及山东省泰安和青岛市基因序列同源性高,呈现出明显地域性特点。核苷酸变异以碱基转(颠)换为主,2018年SFTSV分离株共存在0.03%氨基酸突变位点,2019年存在0.02%氨基酸突变位点,2020年存在0.11%氨基酸突变,2020年较2018、2019年明显增多。结论利用测序方法测定的济南市SFTSV,其基因组序列分析表明与我国流行的SFTSV相近,氨基酸序列突变有增多趋势,需密切关注其致病力、毒力及传播力的改变。
- 赵红赵怀龙杨国樑韩莹潘晶赵宝添刘岚铮
- 关键词：发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒全基因组序列进化分析
- 2015年济南市环境中禽流感病毒监测与分析被引量：6
- 2016年
- 目的通过对济南市涉禽环境禽流感病毒监测,了解H5、H7和H9亚型禽流感病毒在外环境分布情况,为禽流感的防控提供科学依据。方法 2015年按季度采集济南市3类涉禽场所不同种类环境样本1 260份,采用实时荧光定量PCR法检测禽流感病毒核酸,使用Epi Info统计分析数据。结果甲型流感病毒（Influenza A virus,Flu A）在活禽农贸市场和大型家禽养殖场阳性率分别为29.67%和2.86%,集中散养户未检出Flu A,3类场所检出率差异有统计学意义（χ^2=55.77,P〈0.001）。活禽农贸市场H9和H5亚型检出率分别为16.11%和6.67%,未检出H7亚型,3种亚型检出率差异有统计学意义（χ^2=18.18,P〈0.001）。Flu A在案板涂抹物、清洗禽类污水、禽类饮水、笼具涂抹物和禽粪检出率分别为50.00%、37.90%、20.66%、13.21%和13.11%,不同种类标本Flu A的检出率差异有统计学意义（χ^2=54.69,P〈0.001）。采样季度对Flu A检出率差异无统计学意义（χ^2=0.53,P〉0.05）。结论济南市环境中存在H5和H9亚型禽流感病毒,以H9亚型为主;活禽农贸市场是感染禽流感的危险场所。应加大对活禽农贸市场的消毒力度,加强对禽流感病毒的持续监测。
- 徐倩杨国樑赵红关恒云赵怀龙吕燕
- 关键词：禽流感病毒实时荧光定量PCR
- 济南市47例新型冠状病毒肺炎患者取样部位对核酸检测结果的影响被引量：3
- 2020年
- 目的探讨济南市新型冠状病毒肺炎患者取样部位对核酸检测结果的影响。方法选择2020年1月22日至2月11日经我中心确诊的47例新型冠状病毒肺炎患者的临床样本,应用实时荧光定量RT-PCR法进行检测,分析不同取样部位临床样本对检测结果的影响,采用Fisher精确概率法进行统计学分析。结果济南市共报告新型冠状病毒肺炎确诊患者47例,男23例,女24例,11个月~71岁,中位年龄35岁。鼻咽拭子样本新型冠状病毒核酸阳性率91.11%(41/45),痰液样本的核酸阳性率92.31%(13/14),两种样本检出率差异无统计学意义(Fisher精确概率法,双侧P>0.999),但痰液样本的荧光RT-PCR检测Ct值明显低于对应的鼻咽拭子样本。结论鼻咽拭子样本能够满足新型冠状病毒感染筛查及确诊要求,深咳痰液样本可作为鼻咽拭子"假阴性"的有效补充。
- 赵怀龙吕燕赵红赵宝添韩莹杨国樑王春荣关恒云刘辉刘岚铮
- 关键词：核酸检测实时荧光RT-PCR假阴性反应
- 基于谱效关系的金莲花抗肠道病毒71型物质基础研究被引量：4
- 2022年
- 目的:对金莲花抗肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)物质基础进行研究。方法:通过建立超高效液相色谱-串联二极管阵列检测器-飞行时间质谱(UPLC-DAD-TOF/MS)指纹图谱对金莲花物质基础进行表征,通过噻唑蓝(MTT)法对金莲花抗EV71病毒抑制率进行检测,通过正交偏最小二乘法(OPLS)和灰色关联分析法(GRA)对金莲花物质基础和病毒抑制率进行谱效相关关联分析。结果:建立了20批次金莲花样品的指纹图谱,标定了31个共有峰,并进行了质谱解析;建立了金莲花对EV71抑制率检测方法,20批次金莲花的病毒抑制率为49.64%~73.69%;OPLS和GRA分析结果表明,共有峰12、13、14、18可能为金莲花抗EV71物质基础。结论:共有峰12(番石榴酸)、13(未鉴定的生物碱成分)、14(对羟基苯甲苹果酸)和18(2″-O-乙酰基荭草苷)可能为金莲花抗EV71物质基础,此可为金莲花质量标准的建立和金莲花抗病毒研究提供借鉴和数据支持。
- 张天泽郭威赵怀龙李双双王亮
- 关键词：肠道病毒71型谱效关系
- 济南市2012~2017年手足口病4种优势肠道病毒阳性及VP1基因型分布被引量：1
- 2021年
- 目的阐明济南市手足口病优势肠道病毒感染类型及VP1基因型分布。方法采用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)对2012~2017年济南市4 929份手足口病病例标本进行肠道病毒71型(EV-A71)、柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)、柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)和柯萨奇病毒A组10型(CV-A10)进行鉴定。按照不同年份回顾性收集手足口病病毒分离株65株,包括17株EV-A71、16株CV-A16、20株CV-A6和12株CV-A10。采用RT-PCR方法扩增肠道病毒VP1特异性基因并进行核苷酸序列测定;获得的目的基因序列进行核苷酸同源性分析并构建系统进化树。结果济南市手足口病优势肠道病毒类型为CV-A16(28.3%)、EV-A71(27.3%)、CV-A6(17.0%)、CV-A10(3.0%)。4种优势肠道病毒VP1基因目的片段长度分别为891 bp、1 015 bp、1 110 bp和993 bp。济南市EV-A71病毒株间核苷酸序列同源性为93.0%~98.1%,CV-A16为87.4%~100.0%,CV-A6为87.6%~99.7%,CV-A10为95.8%~99.4%。系统进化树分析显示,济南市EV-A71均为C4a亚型;CV-A16存在B1b型和B1a型两种基因亚型;CV-A6在系统进化树的C簇、E簇和F簇均有分布;CV-A10全部位于进化树E簇。结论 CV-A16、EV-A71、CV-A6和CV-A10为济南市2012~2017年手足口病的优势肠道病毒;长期动态监测肠道病毒VP1基因型分布,对于提高手足口病预警敏感性具有重要的公共卫生意义。
- 关恒云王春荣刘岚铮赵怀龙白爱英姜慧钰董华李娜单晓英成洪旗
- 关键词：手足口病肠道病毒VP1基因系统进化分析
- 济南市人鼻病毒B83型基因组特征及分子变异分析被引量：2
- 2021年
- 目的对济南市2020年常规监测鉴定的人鼻病毒(HRV)进行基因组测序并分析其特征及变异情况。方法荧光定量RT-PCR方法对流感监测点采集的流感样病例样本进行筛查,进而通过宏基因组测序方法获得基因组序列,利用Lasergene和MEGA等软件进行分子变异及系统进化分析。结果 HRV JN909株基因组序列全长7219 nt,为鼻病毒B83型。根据VP4/VP2基因序列建立的系统发育树及主要结构蛋白基因与氨基酸同源性比对,JN909株与2019年美国西雅图来源的HRV SC0340株(GenBank登录号:MN306025)亲缘关系较近,其开读框(ORF)核苷酸与氨基酸序列的同源性分别为98.5%与99.7%,二者仅有6个氨基酸残基位点发生变异,其中VP1蛋白发生A23T和P275L变异。结论 HRV JN909株与美国SC0340株具有极高的同源性,共发生6个氨基酸位点变异。
- 赵怀龙吕燕赵红赵宝添韩莹潘晶丁小满王春荣韩秀云刘岚铮
- 关键词：系统进化树基因组突变
- 济南市轻重症手足口病患儿肠道病毒71型结构蛋白基因特征分析被引量：2
- 2020年
- 目的比较分析济南市轻重症手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)结构蛋白基因及氨基酸变异情况。方法对2017年济南市轻重症手足口病患儿EV71细胞分离株结构蛋白基因序列进行RT-PCR扩增测序,应用EditSeq和MegAlign等软件对结构蛋白基因进行序列拼接及核苷酸、氨基酸同源性比对,应用Mega 5.2软件构建VP1基因系统进化树。结果轻重症患儿EV71分离株结构蛋白基因核苷酸和氨基酸同源性分别为93.0%~98.8%和99.0%~99.8%,均属于C4a基因亚型。经VP1基因同源性分析,济南市EV71分离株与2017年江苏株(GenBank ID:MG520666,同源性99.3%)、2015年河南株(KU744452,同源性99.2%)、2015年北京株(KU376386,同源性99.2%)及2016年山东潍坊株(MG588036,同源性99.0%)亲缘关系较近。死亡患儿EV71分离株VP1蛋白出现E145Q突变,重症EV71分离株分别出现VP1蛋白A19V、T101I,VP3蛋白M150I突变。结论济南市轻重症HFMD患儿EV71分离株均属于C4a亚型,与江苏、河南、山东及北京等地的EV71株亲缘关系较近,其VP1蛋白145位氨基酸残基可能是影响病毒毒力的重要位点。
- 赵怀龙王春荣杨国樑赵宝添吕燕刘岚铮
- 关键词：手足口病肠道病毒71型结构基因系统进化树
- 1例不明原因新型冠状病毒肺炎及其密切接触者调查分析被引量：2
- 2020年
- 目的回顾性分析济南市1例感染原因不明的新型冠状病毒肺炎病例引起的家庭聚集性疫情。方法应用现场流行病学方法调查1例新型冠状病毒肺炎病例及其2例2代病例,并对29名密切接触者实施医学隔离观察,采用RT-PCR对采集的相关标本进行新型冠状病毒肺炎病毒核酸检测。结果3例新型冠状病毒肺炎确诊病例为家庭聚集性病例。首发病例(病例A)发病前有短期外出史,感染来源不明确。病例B、C因与病例A共同生活被传染。接触时间短、接触频率较低、有一定防护措施的密切接触者经核酸检测、医学观察,均未出现异常。结论新型冠状病毒的传播力强,应该把早期发现和早期隔离筛查密切接触者作为防控重点。
- 刘仲赵梦娇杨国樑赵怀龙王琳琳常彩云耿兴义
- 关键词：聚集性流行病学调查密切接触者
- 2015-2016年济南市活禽市场禽流感病毒监测及污染特征分析
- 目的：监测济南市活禽市场外环境样本中A型禽流感病毒动态分布状况,分析禽流感病毒污染特征.
方法：于2015年11月至2016年10月,选择济南市所属槐荫区活禽批发市场与历城区活禽零售市场进行外环境样本采集,样本...
- 赵怀龙杨国樑吕燕耿兴义徐倩赵红刘岚铮
- 关键词：禽流感污染特征疫情防控
- 2017年济南市柯萨奇病毒A16型VP1基因特征分析被引量：3
- 2019年
- 目的对济南市2017年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原中的柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)分离鉴定,分析VP1基因遗传进化特征。方法整理分析2017年济南市HFMD监测样本,采用简单随机抽样方法选取CV-A16核酸阳性样本经预处理后接种人横纹肌肉瘤(human rhabdomyosarcoma,RD)细胞,对产生明显细胞病变效应的毒株进行鉴定,测定VP1基因序列,应用MEGA5.2软件构建系统进化树,通过Lasergene软件对VP1进行核苷酸及氨基酸同源性分析。结果通过细胞分离获得10株CV-A16阳性病毒株,均属B1b亚型,分别位于3个不同簇,核苷酸及氨基酸序列同源性分别为94.9%~100%和99.3%~100%,与我国CV-A16上海株(KX871333)(同源性99.7%)、河南株(KM260134)(99.0%)、江苏株(KP751580、KR138327)(98.7%)及广东株(MH004016)(98.5%)亲缘关系较近。与国内参考株相比,济南市CV-A16分离株VP1存在N14S、S59R、E145V变异。结论CV-A16病毒株B1b基因亚型为济南市优势毒株,VP1蛋白发生氨基酸变异。
- 赵怀龙隋竑弢杨国樑关恒云王春荣刘岚铮
- 关键词：手足口病柯萨奇病毒A组16型系统进化树
