赵忠海 作品数:36 被引量:97 H指数:6 供职机构: 贵州大学 更多>> 发文基金: 教育部科学技术研究重点项目 贵州省科技厅重大专项 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 理学 更多>>
兴义鸭肌肉生长抑制素基因多态性与屠宰性状的相关性分析 被引量:3 2014年 为了解兴义鸭肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因SNPs与屠宰性状的相关性,本研究采用基因克隆及PCR产物直接测序的方法,将MSTN基因作为鸭屠宰性状的候选基因,对兴义鸭的MSTN基因外显子进行多态性检测。结果表明,在60个兴义鸭个体中筛选出8个SNPs,其中,第1外显子有5个突变位点:SNP1(G77A)、SNP2(A91G)、SNP3(G130A)、SNP4(C325T)和SNP5(C331T);在第2外显子中并未发现突变位点;第3外显子有3个突变位点:SNP6(C206T)、SNP7(A235G)和SNP8(C256A);对这8个SNPs与屠宰性状进行关联性分析,结果并未达到显著水平(P>0.05)。本研究结果可丰富MSTN基因的研究数据,为鸭的育种提供参考。 彭邦星 李辉 易恒洁 赵忠海关键词:肌肉生长抑制素基因 屠宰性状 三穗鸭MSTN基因多态性与屠宰性状相关性研究 被引量:4 2013年 为了解三穗鸭肌肉生长抑制素(MSTN)基因SNPs与屠宰性状的相关性,本研究采用PCR产物直接测序的方法对三穗鸭肌肉生长抑制素基因外显子的多态性进行检测,结果在研究群体中发现6个SNP位点:SNP1(G76A)、SNP2(A90G)、SNP3(G129A)、SNP4(G234A)、SNP5(A255C)、SNP6(G276A)。采用固定效应模型分析基因多态性与屠宰性状的相关关系,结果显示:在SNP1位点,BB基因型个体的腿肌重、腿肌率和瘦肉率平均值显著高于AA和AB基因型;在SNP2位点,CD基因型个体的胸肌率平均值显著高于CC基因型,SNP4和SNP5在本试验中完全连锁,HH/NN基因型个体的半净膛重和全净膛重平均值显著高于GG/MM和GH/MN基因型,SNP3和SNP6的不同基因型对屠宰性状各指标效应不显著。研究揭示MSTN基因的多态性对三穗鸭屠体性状具有重要影响。 易恒洁 李辉 杨胜林 赵忠海 彭邦星关键词:三穗鸭 肌肉生长抑制素基因 屠宰性状 用于鉴定赤水乌骨鸡绿壳基因型的引物及其应用与使用方法 本发明提供了一种用于鉴定赤水乌骨鸡绿壳基因型的引物及其应用与使用方法。本发明通过设计合成的3条2对引物,通过对SLCO1B3基因进行多重PCR扩增,观察该基因是否插入了EAV‑HP序列的由引物1和引物2组成的引物组合物,... 李辉 陈林 赵忠海 卜小雁 师新彩 杨华婷 李兴才文献传递 贵妃鸡肉质性状研究 2013年 以贵妃鸡为试验素材,在常规饲养条件下饲养至13周龄,测定胸部肌肉嫩度、水分、粗蛋白、粗脂肪及氨基酸含量。结果显示:贵妃鸡嫩度平均为1.490,水分、粗蛋白、粗脂肪和粗灰分的含量分别为73.357%、23.132%、1.466%和1.788%。贵妃鸡胸肌氨基酸含量丰富,共检测到16种氨基酸,其中7种为人体必需氨基酸,占氨基酸总量的39.59%。 李辉 吴婵 易恒洁 彭邦星 赵忠海关键词:贵妃鸡 肉质 氨基酸 高坡猪PRKAA1基因多态性检测及生物信息学分析 被引量:1 2016年 为了对PRKAA1基因的遗传机理进行更进一步的研究,本试验以高坡猪为研究对象,利用PCR技术对PRKAA1基因的全部外显子进行克隆扩增,并对扩增产物进行正反向直接测序,运用生物信息软件进行序列分析;结果表明,仅在第7外显子75 bp处发现了A/G 1个单核苷酸突变位点,且该位点突变导致氨基酸密码子由CAA变为CAG,所对应编码的氨基酸也由谷酰胺酸(Gln)变为精氨酸(Arg),由于氨基酸的改变导致了PRKAA1基因的mRNA二级结构和蛋白质三级结构发生了构象改变。突变前后该蛋白分子量分别为136.152 k D和136.166 k D,PRKAA1蛋白无跨膜结构,不属于分泌蛋白。本研究结果可为高坡猪的PRKAA1基因表达载体的构建提供依据。 张蓉 李辉 赵忠海 施晓丽 易恒洁 石璇 王成栋关键词:多态性 生物信息学 高坡猪肌肉生长抑制素基因多态性及其与肉质性状的相关性分析 被引量:14 2017年 为了探讨肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因的多态性对高坡猪肉质性状(水分、粗脂肪、粗蛋白质、粗灰分、眼肌面积、大理石纹、pH、肉色、嫩度、滴水损失、失水率)的影响,试验以MSTN基因作为肉质性状候选基因,以10月龄的50头高坡猪为研究对象,采用PCR扩增产物直接测序的方法对高坡猪MSTN基因3个外显子的单核苷酸多态性(SNP)进行研究,运用SPSS 20.0软件分析MSTN基因SNP与肉质性状的关联性。结果表明,仅在高坡猪MSTN基因第3外显子63bp处检测到1个C/T突变位点,该突变为同义突变,未引起编码氨基酸的改变。基因型分析发现,仅有3个个体在该位点发生突变,CC基因型为优势基因型,C为优势等位基因,无TT纯合基因型。经χ~2适合性检验分析,该SNP在研究群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。群体遗传参数分析发现,C63T标记位点的杂合度(He)相对较低,表明其在高坡猪群体中的变异较小;就多态信息含量(PIC)而言,该位点属于低度多态(PIC<0.25),说明该遗传标记能够提供少量的遗传信息。将该位点的不同基因型与肉质性状指标进行关联分析表明,所有肉质性状指标在不同基因型间差异均不显著(P>0.05)。综上所述,MSTN基因外显子在高坡猪中存在多态性,但变异较少,相对保守,能否作为高坡猪肉质性状的遗传标记有待于扩大样本数量进一步研究。 易恒洁 李辉 赵忠海 杨华婷 彭邦星 王玉关键词:MSTN基因 肉质性状 70周龄长顺绿壳蛋鸡HO-1基因在不同组织中表达差异研究 被引量:3 2017年 为研究HO-1基因在70周龄长顺绿壳蛋鸡不同组织中的表达差异,选取70周龄长顺绿壳蛋鸡9只(每种基因型3只),采集每只鸡的大脑、肝脏、肾脏、卵巢、输卵管和子宫组织,提取其总RNA进行反转录,利用实时荧光定量PCR方法检测样品中HO-1基因的表达水平,比较同一组织不同基因型及同一基因型不同组织间HO1基因mRNA的表达差异。结果表明,在同一组织不同基因型及同一基因型不同组织间HO-1基因的表达存在差异;其中HO-1基因在肝脏中表达量最高,且3种基因型间肝脏表达量存在极显著差异(P<0.01);白壳蛋鸡子宫中HO-1基因表达量极显著高于其他两种(P<0.01),纯合绿壳蛋鸡与杂合绿壳蛋鸡无显著差异(P>0.05)。 卜小雁 李辉 施晓丽 师新彩 赵忠海 陈林关键词:HO-1基因 实时荧光定量PCR 一种用于动物组织总RNA提取的方法 本发明公开了一种提取动物组织总RNA的方法。本发明适用于任何畜禽品种,其提取效率高效、方便快捷、减少去RNA酶离心管和移液枪头的使用量,有效降低经济成本,也减少了实验耗材的去RNA酶的处理步骤,尤其对于实验环境条件较差或... 李辉 易恒洁 师新彩 赵忠海 李兴才 杨华婷 陈林 彭邦星 卜小雁文献传递 兴义鸭MEF2A基因的SNPs筛选及其生物信息学分析 被引量:2 2015年 为了解鸭MEF2A基因的功能和结构以及其对鸭遗传效应的影响,采用混合DNA池、基因克隆、PCR产物直接测序和生物信息学相结合的方法 ,对兴义鸭的MEF2A基因进行研究。结果并未发现SNP位点,运用生物信息学方法对其蛋白质一级结构和二级结构进行分析,发现其包含33个α螺旋、20个β折叠、44个无规则卷曲。将获得的鸭的MEF2A蛋白序列与NCBI上提交的家鼠、牛、斑马鱼、猪、鸡的MEF2A序列相比对,结果显示:鸭与鸡、鱼的亲缘关系相近,与家鼠的亲缘关系较远。 彭邦星 李辉 李辉 张达 赵忠海 易恒洁关键词:SNPS 生物信息学 兴义鸭MEF2A基因mRNA在组织中表达研究 被引量:1 2017年 运用RT-PCR和qRT-PCR对兴义鸭NEF2A基因在不同组织中的表达量进行探究。结果表明,心、肝、肺、肾、十二指肠、大脑、胸肌、腿肌、肌胃、腺胃共10个组织中均检测到了MEF2A基因mRNA的表达,说明该基因属于广谱表达基因;同时,还发现该基因呈依赖性组织表达,大脑中的表达量最高,消化器官中表达量相对最低,如肌胃和腺胃。研究结果为兴义鸭组织表达谱构建奠定了基础。 王成栋 李辉 卜小雁 师新彩 彭邦星 易恒洁 赵忠海