马鸣超
- 作品数:72 被引量:800H指数:18
- 供职机构:中国农业科学院农业资源与农业区划研究所更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学环境科学与工程生物学轻工技术与工程更多>>
- 污水人工快速渗滤系统中厌氧氨氧化菌的分子生态学分析被引量:8
- 2008年
- 使用厌氧氨氧化菌的引物从污水人工快速渗滤系统(CRI)砂层样品总DNA中扩增16S rDNA序列,并测序、构建系统发育树,从而确定了其发育地位。结果表明:在CRI系统6号样品(50cm深)中存在厌氧氨氧化菌,测定该菌的16S rDNA部分序列(长度为831bp)与anoxic biofilm clone Pla1-48、uncultured anoxic sludge bacterium KU2和anaerobic ammonium-oxidizing planctomycete KOLL2a等厌氧氨氧化菌的相似性均在97%以上,表明它们的系统发育关系比较相似。厌氧氨氧化菌的发现为此工艺的改进和反硝化能力的提高提供了新的思路。
- 姜昕马鸣超李俊钟佐燊
- 关键词:人工快速渗滤系统厌氧氨氧化菌
- 大豆根瘤菌菌株5873 PCR快速检测方法的建立及应用效果评价
- 2023年
- 【目的】大豆根瘤菌(Bradyrhizobium japonicum)是微生物肥料重要的功能菌种之一,可通过生物固氮为大豆生长提供氮素,实现节本增效,菌株5873作为其典型代表,已广泛应用于农业生产。筛选并鉴定其特异引物,建立大豆根瘤菌5873菌株水平的快速检测方法,对微生物肥料生产菌种鉴定、产品质量检测和功能评价至关重要。【方法】以商业化菌株大豆根瘤菌5873为供试材料,基于其全基因组序列和NCBI数据库中大豆根瘤菌种内参比菌株相关序列,以及与其高度同源(基因组ANI值大于99.95%)的大豆根瘤菌USDA 6T差异片段,通过多重序列比对,进行特异引物设计和筛选,获得特异性引物对,并通过对PCR反应条件/体系优化、特异性及灵敏度检测,建立大豆根瘤菌5873的快速检测方法。然后,采用盆栽试验,将大豆根瘤菌5873与其他根瘤菌菌株混合接种于大豆根际,应用上述方法对大豆根瘤菌5873竞争结瘤能力进行评价和方法验证。【结果】筛选获得了一组特异引物4-4和Q1(4-4-F 5′-GATAAGGCCACGGGTGAACA-3′/4-4-R 5′-CACTCGATAAGCTCCGCTGT-3′和Q1-F 5′-CCGGTCGTGACTGGAATGAT-3′/Q1-R 5′-TCGAGGCCTACAAGAACGTC-3′),优化并建立了PCR快速检测方法,即反应体系:Premix TaqTM 12.5μL,引物各1.0μL,基因组DNA 15 ng左右,加ddH2O补足至25μL;反应条件:95℃预热5 min,94℃变性45 s,61℃退火45 s,72℃延伸60 s,30个循环,再72℃延伸10 min。通过凝胶电泳检测目的条带的有无(355和218 bp),即可实现大豆根瘤菌5873的快速检测,该方法检出灵敏度为1850 CFU/μL。此外,借助该方法可以成功地评价大豆根瘤菌5873竞争结瘤能力,与传统BOX-PCR评价结果一致。【结论】大豆根瘤菌5873快速鉴定方法的建立实现了以菌体发酵液或根瘤破碎提取液为模板,直接进行PCR扩增的鉴定操作,省去了根瘤的分离、根瘤菌分离纯化、培养、DNA提取及测序鉴定等繁琐的环节,大大减少了�
- 马鸣超姜昕王鹏辉关大伟李俊
- 关键词:大豆根瘤菌特异引物PCR扩增竞争结瘤
- 根瘤菌与促生菌复合接种对大豆生长和土壤生态效应的影响
- 目的:本研究以P.mucilaginosus 3016与B.japonicum 5136为研究对象,通过田间小区试验研究根瘤菌与促生菌复合接种对大豆生长结瘤及品质、土壤肥力(土壤理化性质、土壤酶活)和土壤微生物区系等方面...
- 姜昕马鸣超李俊
- 关键词:大豆土壤生态效应根瘤菌促生菌
- 文献传递
- 一种提高微生物肥料样品测定均匀性的方法
- 本发明是一种提高微生物肥料样品测定均匀性的方法,属于微生物肥料产品检测检验技术领域。所述方法包括NY/T 2321‑2013微生物肥料产品检验规程中有效活菌数的培养基平板制备、系列稀释、加样与培养、菌落识别、菌落计数与结...
- 朱玲玲姜昕李俊马鸣超曹凤明杨小红关大伟李力陈慧君赵海洲季洪伟贾聪刘孝颖
- 一种蒽降解菌株及其分离筛选方法
- 本发明一种蒽降解菌株及其分离筛选方法,属于微生物技术领域。蒽降解菌株<I>Pseudomonas </I><I>stutzeri </I>R4004‑2,CGMCC No.27049。其在肉汤平板培养基上菌落直径在0.2...
- 马鸣超姜昕李俊朱倬漪曹凤明杨小红关大伟李力陈慧君
- 人工快速渗滤系统中硝化菌群脱氮作用解析
- 采用16S rDNA的DGGE技术研究人工快速渗滤系统(CRI)中硝化菌群(氨氧化菌和亚硝酸氧化菌)的空间分布规律。结果表明,采用机械破壁、酚氯仿抽提和巢式PCR的方法处理样品,为后续的DGGE提供了理想的模板;DGGE...
- 马鸣超姜昕李俊何江涛
- 关键词:硝化菌群
- 文献传递
- 不同施肥处理对农田土壤微生物区系和功能的影响被引量:32
- 2014年
- 本研究采用DGGE和Biolog两种方法,研究了五种不同施肥处理对土壤微生物区系组成和功能的影响。采用UPGMA对DGGE试验结果进行聚类分析得出,小麦季中不施肥对照(T1)和常规氮磷钾肥(T2)聚为一类,相似性为41%,常规氮磷钾肥+秸秆还田(T4)和常规氮磷钾肥+秸秆还田+秸秆腐熟剂(T5)聚为一类,相似性为52%,而70%常规氮磷钾肥+有机肥(T3)单独聚为一类;玉米季也得到类似的结果,只是T1和T2的相似性为68%,T4和T5相似性达78%,而T3依然归为一类,这说明不同施肥处理间土壤微生物区系存在相似性。经过切胶测序及BLAST比对,发现大多为不可培养细菌,可培养细菌中多为芽孢杆菌属和类芽孢杆菌属。Biolog试验采用主成份分析得出,T1和T2土壤微生物功能类似,T4和T5土壤微生物也具有相似的功能,而T3则单独分为一类。其中,T5和T4的土壤细菌群落对底物碳源的代谢活性最强,T3处理次之,T2和T1最低。通过这两种不同试验方法的分析可以看出,不同施肥处理对土壤微生物区系和功能的影响存在关联性。
- 武晓森杜广红穆春雷马鸣超周晓琳赵同凯朱宝成李洪杰沈德龙
- 关键词:施肥微生物区系DGGEBIOLOG
- 枯草芽孢杆菌近缘种群鉴定方法研究进展被引量:49
- 2014年
- 枯草芽孢杆菌近缘种群(简称枯草群)是一群表型相似的革兰氏阳性、产芽孢的杆菌,目前该群已包括10个有效发表种。该群细菌广泛应用于生物技术、工业和农业等领域,因此实现菌株的快速准确鉴别与鉴定,确保其使用的安全性和有效性是首要条件。本文在本研究室进行的枯草群鉴定研究基础上,总结提出了基于形态和生化特性测定的传统经典方法和以分子生物学技术为基础的基因序列分析技术、特异PCR技术,并在实践上进行了大量的验证,对指导该种群的准确鉴定与快速鉴别具有重要应用价值。
- 曹凤明杨小红马鸣超陈慧君沈德龙李俊
- 关键词:生化特性
- 微生物肥料产品质量安全风险因子识别及现状评价被引量:10
- 2016年
- 微生物肥料在推进绿色生态农业发展中有不可替代的作用。本文针对微生物肥料产品的组成和特点,对产品中的功能微生物菌种和原料辅料中潜在的风险因子进行了识别和危害描述,并对2016年代表性微生物肥料产品及菌株进行了质量安全分析评价,阐述了其质量安全现状,提出了4方面的微生物肥料产品质量安全风险评估对策与建议。
- 马鸣超姜昕曹凤明李力关大伟李俊
- 关键词:风险评估
- 用DGGE技术分析污水人工快速渗滤系统中微生物种群分布被引量:12
- 2007年
- 从深圳运行中的人工快速渗滤系统(CRI)的砂层填料中以5cm^10cm间隔垂直取10个样品,进行16S rDNAV3区的DGGE分析,结果表明,CRI系统中微生物种群随着深度的增加逐渐减少,在快渗池砂层填料的30cm深度范围内,微生物群落组成至少有18种,主要是Firmicutes、alpha proteobacterium中的异养菌,它们是COD降解的主要参与者;而在40cm及更深范围,菌群减少为12种甚至更少,优势菌是Acidovorax sp.、Nitrospira sp.、Clostridium sp.等,表明快渗池下部存在较强的硝化作用和厌氧的微环境,快渗池上、下层之间呈现出不同的多样性。结果揭示出CRI系统中的微生物种群空间分布状况,为其处理效果的稳定和提高提供了理论基础。
- 姜昕马鸣超李俊李力钟佐燊
- 关键词:人工快渗系统RDNA