赵洪斌
- 作品数：3 被引量：30H指数：2
- 供职机构：中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程重要方向项目国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 北京地区乙肝病毒S基因序列多态性及其分布被引量：8
- 2007年
- 目的:探讨HBV的S基因序列多态性、基因型/血清型在北京地区的分布特征以及基因型/血清型与临床症状的可能相关性方法:对69例样品进行S区聚合酶链反应扩增测序,通过标准序列使用MEGA3.1和DnaSP软件分析核苷酸差异度,比较基因型、血清亚型的核酸及蛋白质差异.结果:在69例北京地区样品中检测出C基因型55例(79.7%),B基因型14例(20.3%);adrq^+和adw2分别为52和14例,2例血清亚型未见报道.S基因核苷酸差异度分布不均匀,在C型中较高.非同义突变类型多分布在疏水区中,亲水区多为同义突变.临床症状在B,C基因型中有显著性差异.结论:S基因的序列差异在C型中高于B型;DNA序列突变在S基因中呈非随机分布,疏水区突变率高而两个亲水区比较保守.
- 王继荣周莉赵洪斌季芬丁惠国曾长青
- 关键词：乙型肝炎病毒S基因多态性基因型血清型聚合酶链反应
- 高通量飞行时间质谱基因分型方法的研究被引量：22
- 2005年
- 为了考察飞行时间质谱基因分型方法(MALDI-TOF)的位点分型成功率和分型结果质量的关系,分析了96个SNPs位点的近10000个基因分型数据(用MALDI-TOF“4重”实验方法检测).结果显示,位点分型成功率和分型结果的质量显著正相关.分型成功率低于82%的SNP位点,其高质量结果占的比例开始逐渐降低.提示82%的分型成功率可以作为衡量分型结果质量的数据点.为了进一步提高通量并降低成本,在MALDI-TOF“4重”实验方法的基础上,发展了两种“准8重”实验方法.用新的实验方法检测了95个样本的32个SNPs位点.结果显示“混合准8重”实验方法与“4重”实验方法相比无显著差异,而“复点准8重”的结果差于“4重”分型方法.
- 赵辉王威张清润高扬赵洪斌周珺林伟曾长青
- 关键词：飞行时间质谱基因分型
- 染色体8p23区域的基因流研究和北京地区乙肝病毒多态性研究
- 赵洪斌
- 关键词：倒位基因流乙型肝炎病毒
