黄荣莲 作品数:76 被引量:256 H指数:11 供职机构: 广东海洋大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省科技计划工业攻关项目 广东省自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 文化科学 经济管理 更多>>
马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)近交家系与其杂交子代DNA甲基化差异分析 被引量:4 2018年 2012年4月,利用马氏珠母贝全同胞家系进行家系内与家系间交配组合构建了近交家系(A与D)与杂交家系(B与C)。贝龄2龄时,比较家系生长性状差异,利用甲基化敏感多态性扩增技术(MSAP)检测了4个家系甲基化水平的差异,估计了甲基化比例与生长性状平均值相关性系数。结果表明,家系杂交子代的平均壳长、平均壳高、平均壳宽与平均体重均值大于近交家系,性状优势率为8.5%~24.7%;近交家系与杂交家系的总条带数和甲基化比例均存在显著性差异(p〈0.05)。近交家系A和D获得的总条带数分别729.0±19.6与717.3±28.2,甲基化水平分别为(10.0±0.9)%与(8.5±0.4)%;杂交家系B和C获得的总条带数分别为703.0±10.7与726.3±18.8,甲基化比例分别为(5.9±0.7)%与(5.7±0.9)%;家系的平均壳长、平均壳高、平均壳宽与平均体重性状与甲基化均存在明显负相关,相关系数分别为-0.849、-0.751、-0.674和-0.652。 杨晶淼 蔡炜裕 罗少杰 王庆恒 焦钰 焦钰 邓岳文关键词:马氏珠母贝 杂交 甲基化 MSAP 海洋酸化对马氏珠母贝珍珠层形成的影响 被引量:6 2015年 分析了酸化环境对马氏珠母贝珍珠层形成的影响。在温度为28℃,盐度为31的条件下,分别在p H 8.2(对照组,CG)、p H 7.7(实验一组,E1)和p H 7.4(实验二组,E2)的海水中养殖马氏珠母贝,观察贝壳珍珠层结晶形貌的变化,并检测珍珠层形成相关的矿化基因(pif177、nacrein及pearlin)在外套膜中央区(mantle center,MC)的表达。结果表明:(1)通过扫描电镜观察贝壳,比较对照组与实验组贝壳晶体形貌变化,发现E1组贝壳珍珠层低倍镜下,生长阶梯明显,高倍镜下超微结构规则,六边形棱角不明显,但边界清晰;而E2组出现板块边界不明显,生长排列不规则等现象,说明了海水酸化影响了马氏珠母贝的钙沉积,引起珍珠层形貌特征的变化;(2)实验设定条件下,pif177、nacrein及pearlin基因表达量整体上呈现随p H降低而降低的变化趋势。其中,E1组与CG组间均无显著性差异(P>0.05),E2组均较CG组显著下调(P<0.05)。 董冰冰 黄荣莲 王庆恒 郑哲 焦钰 邓岳文 杜晓东关键词:海洋酸化 马氏珠母贝 珍珠层 基因表达 矿化 合浦珠母贝两个种群染色体组型的分析 被引量:4 2001年 以北部湾和大亚湾两个地域的野生合浦珠母贝种群为研究对象 ,采用成贝的鳃组织 ,经空气干燥法制片进行染色体组型分析。结果表明两地种群的核型公式都为 2 N=2 8=16m+6sm+4st+2 t,NF=50 ,但在染色体排序方面表现出较明显的群体差异。并与以往研究报道相比较 。 黄荣莲 杜晓东 叶富良关键词:合浦珠母贝 染色体组型 基于RNA-seq技术马氏珠母贝珍珠囊转录组及数字基因表达谱分析 以马氏珠母贝Pinctada martensii为对象构建了不同发育时期珍珠囊转录组文库和6个数字基因表达谱(Digital gene expression,DGE)文库,进行RNA-seq测序和生物信息学分析,利用荧光... 赵晓霞 焦钰 黄荣莲 邓岳文 杜晓东关键词:马氏珠母贝 珍珠囊 转录组 差异表达基因 文献传递 不同温度和盐度条件下马氏珠母贝选系F_2与对照群体滤食率比较 被引量:2 2010年 以马氏珠母贝选系F2和对照群体为材料,比较了不同温度和盐度条件下选系F2大个体组(SL)、选系F2小个体组(SS)、对照群体大个体组(CL)和对照群体小个体组(CS)的滤食率的差异。结果表明:在15,20,25和30℃条件下,SL组的滤水率显著大于CL组(P<0.05),SS组的滤水率显著大于CS组(P<0.05);在20,24和28‰盐度条件下,SL组的滤水率显著大于CL组(P<0.05),SS组的滤水率显著大于CS组(P<0.05);在32‰盐度条件下,CL组的滤水率大于SL组,CS组的滤水率大于SS组,但两者的差异均不显著(P>0.05)。本结果说明选系F2的快速生长与其较高的滤食率相一致。 邓岳文 王庆恒 杜晓东 黄荣莲关键词:马氏珠母贝 滤食率 盐度 一种用于珍珠贝插核的插核器控制优化方法 本发明公开了一种用于珍珠贝插核的插核器控制优化方法,涉及PID控制领域,包括:S1、获取珍珠贝内部图像数据,建立二维图像,并对所述二维图像划分位置坐标,将插核的目标位置坐标标记为(x<Sub>1</Sub>,y<Sub>... 张家炜 郑哲 廖永山 王庆恒 邓岳文 杨创业 黄荣莲翡翠贻贝3个野生种群遗传多样性分析 被引量:13 2007年 采用表型性状、RAPD和ISSR分子标记对取自广西北海、广东湛江和汕尾的3个翡翠贻贝Perna viridis种群进行遗传多样性分析。翡翠贻贝种群间表型性状(壳长、壳高、壳宽、软体部重、体重和肥满度指数)存在显著的差异(p<0.05)。11个RAPD引物共扩增出114条带,扩增片断大小为237—2099 bp,种群的多态性位点比例和遗传多样性指数分别为57.14%—60.78%和0.174 8—0.190 1。10个ISSR引物共扩增出134条带,扩增片断大小为218—2 695 bp,种群的多态性位点比例和遗传多样性指数分别为72.48%—75.22%和0.245 7—0.253 4。RAPD和ISSR分析都表明汕尾与北海翡翠贻贝种群间的遗传距离最大。结果表明,(1)翡翠贻贝种群具有较高的遗传多样性;(2)RAPD与ISSR标记适合于翡翠贻贝遗传多样性分析,但ISSR比RAPD能检测到种群间更高的遗传变异。 杜晓东 李康 黄荣莲 王庆恒 邓岳文关键词:VIRIDIS 表型性状 ISSR 马氏珠母贝CyPB基因的克隆与表达分析 被引量:3 2015年 为了探究亲环蛋白B(Cy PB)在马氏珠母贝中的作用机制,运用c DNA末端快速扩增(RACE)技术克隆得到马氏珠母贝Cy PB基因(Pm Cy PB)c DNA的全长序列,并且应用实时荧光定量PCR技术对Pm Cy PB基因在马氏珠母贝不同组织中的表达进行检测。结果显示,Pm Cy PB基因序列全长1266 bp,其中开放阅读框(ORF)为678 bp,编码225个氨基酸,5′-UTR为62 bp,3′-UTR为526 bp。预测其相对分子量为24829.3,理论等电点5.77。多序列比对结果显示Pm Cy PB基因与其他物种的Cy PB具有较高的保守性。SMART软件对Pm Cy PB进行蛋白质序列分析,发现它包含亲环蛋白家族典型的肽脯氨酰顺反异构酶的结构域。实时荧光定量PCR数据分析表明,该Pm Cy PB基因在马氏珠母贝闭壳肌、肝胰腺、血细胞、外套膜、足、性腺、鳃这7种组织中均有表达,在外套膜表达量最高,其次是鳃。结果可为进一步阐述Pm Cy PB在马氏珠母贝中的免疫防御机制提供一定的理论基础。 田荣荣 闫芳 杜晓东 焦钰 黄荣莲 王庆恒 邓岳文关键词:马氏珠母贝 CY PB 基因克隆 荧光定量 马氏珠母贝细胞内视黄酸结合蛋白表达及其与类胡萝卜素的相关性分析 被引量:3 2017年 【目的】明确细胞内视黄酸结合蛋白(CRABP)对马氏珠母贝吸收代谢类胡萝卜素的影响,为培育富含类胡萝卜素的马氏珠母贝养殖新品系打下基础。【方法】采用RACE克隆马氏珠母贝CRABP基因(PmCRABP)cDNA全长序列,并以实时荧光定量PCR检测分析PmCRABP基因在各组织中的表达特征及其在黄白闭壳肌中的表达量。【结果】PmCRABP基因cDNA全长1778 bp,开放阅读框(ORF)长366 bp,编码121个氨基酸,其5'非翻译区(5'UTR)长125 bp,3'UTR长1287 bp。PmCRABP的分子量13.51 kD,理论等电点(pI)5.68,脂溶性系数62.81,不稳定指数35.38,总平均亲水性-0.517,其第5~120个氨基酸为Lipocalin家族的结构域。PmCRABP氨基酸序列与新对虾(Metapenaeus ensis)CRABP氨基酸序列的相似度最高,同属于CRABP蛋白,且二者的空间结构极其相似。PmCRABP基因在马氏珠母贝肝胰腺中的表达量最高,其后依次是外套膜、鳃和闭壳肌,各组织的表达量差异显著(P<0.05,下同)。黄白闭壳肌个体的类胡萝卜素含量与PmCRABP基因相对表达量存在显著差异,且二者间呈明显的正相关。【结论】PmCRABP参与了马氏珠母贝的类胡萝卜素代谢。 雷超 郑哲 李俊辉 王庆恒 黄荣莲 邓岳文关键词:马氏珠母贝 类胡萝卜素 克隆 马氏珠母贝TRACP基因的克隆及组织表达 被引量:4 2019年 【目的】克隆马氏珠母贝(Pinctada martensii)抗酒石酸酸性磷酸酶(Tartrate resistant acid phosphatase,TRACP)基因,分析该基因在不同组织中的表达模式。【方法】用RACE技术克隆得马氏珠母贝TRACP基因(PmTRACP),用实时荧光定量PCR分析该基因在外套膜、闭壳肌、足、性腺、珍珠囊、肝胰腺和鳃中的表达。【结果与结论】PmTRACP基因长度为2 034 bp,开放式阅读框972 bp,编码323个氨基酸,5′UTR长度为27 bp,3′UTR长度为1 035 bp。预测PmTRACP分子质量约为36.39 ku,理论等电点为5.97。该基因含有一个钙调神经磷酸酶样磷酸酯酶结构域。PmTRACP与其他物种TRACP的同源性为48%~65%,与长牡蛎(Crassostrea gigas)TRACP的同源性最高,同时D^(32)、D^(70)、Y^(73)、N^(108)、H^(203)、H^(212)、H^(237)、H^(239)等8个氨基酸活性位点和N^(114)糖基化位点在不同物种TRACP中高度保守。PmTRACP与长牡蛎TRACP的亲缘关系最近。PmTRACP在马氏珠母贝各个组织均有表达,且在肝胰腺和珍珠囊中高表达。 郑哲 吴宣瑾 焦钰 黄荣莲 杜晓东关键词:马氏珠母贝 抗酒石酸酸性磷酸酶 基因克隆 基因表达 实时荧光定量PCR