江渊
- 作品数:30 被引量:211H指数:8
- 供职机构:上海市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:上海市卫生局科研基金上海市公共卫生体系建设三年行动计划上海市自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学更多>>
- 液体MGIT培养法在结核分枝杆菌检测中的应用评估被引量:20
- 2013年
- 目的分别用液体分枝杆菌培养管(MGIT)培养法与固体罗氏(L-J)培养法及痰直接涂片抗酸染色检测结核分枝杆菌,评估液体MGIT培养法在结核病诊断中的应用。方法收集上海市松江区中心医院2010年11月至2011年8月肺结核门诊及住院的疑似和确诊后治疗复诊的患者痰标本共1 598例,其中828例为疑似新发患者、770例为已确诊治疗后复诊患者痰标本,所有标本均分别用液体MGIT培养法、固体L-J培养法及痰涂片抗酸染色进行检测。结果疑似新发患者痰液体MGIT培养法报阳时间[(13.63±7.14)d]与固体L-J培养法报阳时间[(28.67±10.04)d]间,复诊患者痰液体MGIT培养法报阳时间[(22.94±9.55)d]与固体L-J培养法报阳时间[(28.53±10.40)d]间差异有统计学意义(P<0.05);疑似新发患者痰液体MGIT培养法培养阳性率[32.00%(265/828)]比痰涂片抗酸染色法[14.80%(123/828)]和固体L-J培养法[17.90%(148/828)]高(P<0.05),复诊患者痰液体MGIT培养法培养阳性率为9.30%(72/770),痰涂片抗酸染色法为6.10%(47/770),二者差异无统计学意义(P>0.05),但比固体L-J培养法[2.60%(20/770)]高(P<0.05);液体MGIT培养法污染率为[6.57%(105/1 598)],比固体L-J培养法[4.00%(64/1 598)]高(P<0.05)。结论液体MGIT培养法在提高阳性率、缩短报阳时间上均优于传统的检测方法,而且操作简便,不需要昂贵设备,在基层医院易于操作和推广。
- 吴学兵陆彬桂晓虹江渊张国英王宏
- 关键词:阳性率结核分枝杆菌
- 恒温扩增-防污染核酸试纸条在快速检测结核分枝杆菌中的应用被引量:4
- 2011年
- 结核分枝杆菌生长缓慢的特性一直以来限制了临床对患者的诊断及治疗。为了快速准确的鉴定结核分枝杆菌,为临床诊断提供有效依据,基于分子生物学技术的诊断方法越来越多的应用到日常的检测工作中,核酸扩增试验(nucleicacid amplification tests,NAAT)自应用到结核病的早期诊断以来,就显示出其强大的优越性。
- 武洁沈鑫张阳奕桂晓虹李静江渊王莉莉方仁东高谦梅建
- 关键词:结核分枝杆菌试纸条防污染分子生物学技术
- 上海市静安区2010-2015年肺结核传播状况及影响因素分析被引量:19
- 2018年
- 目的了解上海市静安区肺结核传播状况及其影响因素。方法收集2010-2015年上海市静安区结核病定点医院诊治的肺结核患者中分离到的结核分枝杆菌进行药物敏感性试验,采用12个位点(QUB11b、QUB18、Mtub21、Miru26、QUB26、Mtub04、Miru31、Miru40、VNTR2372、VNTR3820、3232、4120)结核分枝杆菌可变数目串联重复序列(MIRU-VNTR)多态性分析,结合现场流行病学调查,分析结核分枝杆菌的成簇特征及其影响因素。结果80株结核分枝杆菌菌株总耐药率为28.75%(23/80),总耐多药率为16.25%(13/80)。MIRU-VNTR基因型分型结果显示,58例患者的分离株为单一基因型(72.50%,58/80),22例为成簇菌株,成簇比为27.50%(22/80),共分7个簇,每簇含2-10例菌株。结核分枝杆菌近期传播影响多因素分析结果显示,耐多药(OR=35.799,95%CI:4.239-302.346)和合并症(OR=7.695,95%CI:1.421-41.658)与近期传播有关。成簇病例的现场流行病学调查发现,1个簇患者含有10例耐多药结核病患者(MDR-TB),9例患者相互间认识,有确定的联系,1例患者有可能的联系。结论2010-2015年上海市静安区肺结核患者中存在一定比例的近期传播,耐多药和合并症是结核病近期传播的重要危险因素。
- 韩志英李静顾凯侃孙果梅江渊张阳奕徐飚
- 关键词:肺结核结核分枝杆菌基因分型成簇
- 上海市学校结核病聚集性疫情分析被引量:36
- 2017年
- 目的 了解分析学校结核病聚集性疫情的发生发展,为有效控制其传播提供参考依据.方法 回顾性分析上海市2011年4月至2015年12月间发生的8起学校结核病聚集性疫情的发生发展和处置情况;开展密切接触者筛查和医学观察,随访追踪其发病情况;对培养阳性菌株进行基因型分型,判断患者间的传播情况.结果 8起疫情共12例指示患者.指示患者均为上海市疾病预防控制系统监测发现,7例在寒、暑假期间发病.筛查密切接触者2353名,随后的2年医学观察中有84例发病,6个月内密切接触者发病占后续发现患者的73.81%(62/84),6个月至1年中发病占15.48%(13/84),1年后发病占10.71%(9/84).对2~9例的聚集性疫情进行分级处置,平均处置延误时间由2013年前的47.00 d下降到2013年后15.50 d(经Wilcoxon秩和检验,P<0.05).分子流行病学调查结果显示,2起引起聚集性疫情的8株菌株(一起3株、另一起5株)VNTR14位点基因型拷贝数均相同.结论 应加强学校结核病健康教育,严格落实新生入学体检及学生假期后返校时的传染病自主申报制度,加强疾病预防控制系统的主动监测和对聚集性疫情中密切接触者的管理,及时发现和治疗肺结核患者,有效控制学校结核病聚集性疫情的蔓延和传播.
- 李向群陈静饶立歆江渊李静夏珍栾瑞融沈鑫
- 关键词:院校疾病暴发流行流行病学研究分子流行病学
- 耐药结核菌传播和遗传变异特征及其控制策略研究
- 袁政安高谦沈鑫梅建杨崇广江渊罗涛
- 该项目属于生物医药技术/重大传染病防治领域。主要内容及结果: 鉴于对耐药结核病的流行和传播特征尚缺乏认识,第一部分以全国五个省市为研究现场,对10693株结核菌株进行系统研究,着重分析了耐药结核病的主要构成和发生原因,发...
- 关键词:
- 关键词:传染病防治结核病
- 熔解曲线法在结核分枝杆菌药敏试验质量评估中的应用被引量:7
- 2015年
- 目的 探讨熔解曲线法用于结核分枝杆菌药敏试验质量评估的可行性.方法 以2009年5月至2012年9月间上海市松江区和其他5个区县级结核病诊疗机构收集的2 204株结核分枝杆菌临床菌株为研究对象,比较熔解曲线法的耐药基因型检测结果与比例法药敏试验结果的符合度.对松江区结果不一致的菌株进行盲法复检,并用基因测序方法确定耐药突变类型.结果 上海市松江区的评估结果显示,耐药基因型的分子诊断结果与利福平和异烟肼的药敏试验结果高度一致(κ值分别为0.97和0.99),利福平耐药株的阳性符合度、阴性符合度及总符合度分别为97.6%(41/42)、100% (757/757)和99.9%(788/799),异烟肼分别为100% (72/72)、99.9%(726/727)和99.9%(798/799).盲法复检显示,熔解曲线法诊断的2次检测结果完全相同,具有很好的重复性.而在其他5个诊疗机构(A ~E),熔解曲线法与药敏试验结果的阳性符合度为87.5%(21/24)、80.8%(21/26)、87.5% (14/16)、82.9%(29/35)和60.9% (14/23),异烟肼耐药检测相关数据为88.2%(30/34)、65.6%(21/32)、85.0%(17/20)、68.3%(41/60)和62.5%(15/24),不同诊疗机构之间结果差异具有统计学意义,提示部分诊疗机构可能存在漏检耐药病例的问题.结论 熔解曲线法操作简便,耗时短,且重复性好,能及时发现日常工作中存在的问题,适于药敏试验的质量评估.
- 田际云武洁李静江渊王莉莉沈鑫高谦
- 关键词:熔解曲线法药敏试验
- 实验室检测结核分枝杆菌对吡嗪酰胺耐药性的方法学评价被引量:5
- 2018年
- 目的评估MGIT 960药物敏感性检测法、吡嗪酰胺酶(PZase)活性检测法和pncA基因序列分析法在检测结核分枝杆菌对吡嗪酰胺(PZA)耐药性中的应用价值。方法应用上述3种方法对上海市疾病预防控制中心2014年收集的207株结核分枝杆菌临床分离菌株进行PZA耐药性检测,比较3种方法的耐药性检测结果。结果在207株结核分枝杆菌对PZA的耐药性检测结果中有38株菌3种方法检测结果不一致,对其进行重复性试验,结果显示13株MGIT 960药物敏感性检测法结果为耐药的菌株重复性试验有10株转为敏感,且这10株菌株pncA基因序列分析结果均为敏感。以3种方法结果完全一致或2种方法结果一致的PZA耐药性检测结果为参考结果,MGIT 960药物敏感性检测法、PZase活性检测法和pncA基因序列分析法的敏感性分别为94.8%、100.0%和94.8%,特异性分别为93.3%、83.9%和98.0%。与参考结果的一致性Kappa值分别为0.85、0.74和0.93。结论 MGIT 960药物敏感性检测法和pncA基因序列分析法在检测结核分枝杆菌对PZA的耐药性上具有较好的一致性。MGIT960药物敏感性检测法存在假阳性,建议对MGIT 960药物敏感性检测法检测PZA耐药的样本进行pncA基因序列分析,若二者结果不符则进行MGIT 960药物敏感性重复性试验,以提高PZA耐药性检测的准确性。
- 张阳奕江渊武洁王莉莉郁晨蕾李静
- 关键词:结核分枝杆菌吡嗪酰胺耐药性
- 牛型PPD皮内变态反应试验阳性牛分枝杆菌的分离与鉴定
- 引言本研究对奶牛结核病监测中颈部单纯皮内变态反应试验(Single Intradermal Cervical Tuberculin,SICT)阳性牛采集组织样本进行病原分离和鉴定,以了解上海地区奶牛场分枝杆菌感染情况.材...
- 王曲直江渊沈素芳沈鑫赵洪进唐文红徐峰杨显超刘佩红
- 2007-2012年上海市结核病耐药趋势分析
- 目的 为了解和掌握近几年上海市耐药结核病的流行情况和趋势,本文回顾性分析2007-2012年上海市结核病耐药监测情况,以评价上海市结核病控制效果.方法 收集2007-2012年上海市新登记患者的痰培养阳性菌株,进行一线抗...
- 李静张阳奕武洁江渊王莉莉郁晨蕾沈鑫
- 关键词:结核病控制耐药监测耐药趋势耐药结核病
- 恒温扩增荧光检测法检测结核分枝杆菌复合群的应用价值被引量:4
- 2022年
- 目的:评价恒温扩增荧光检测法检测痰样本中结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)的临床应用价值。方法:选择上海市6家结核病定点医院作为研究现场,收集2020年1月至2020年11月各家医院肺科门诊初诊的1848例疑似肺结核患者痰样本,分别进行恒温扩增荧光检测法与传统的痰涂片、BACTEC MGIT 960液体培养(液体培养)及GeneXpert MTB/RIF(简称“GeneXpert”)检测。以液体培养为参照标准,分析比较恒温扩增荧光检测法、痰涂片及GeneXpert的检测效能。结果:在1848例患者痰样本中,恒温扩增荧光检测法、痰涂片、液体培养和GeneXpert检测MTBC的检出率分别为16.7%(309/1848)、14.4%(266/1848)、25.4%(470/1848)和28.7%(530/1848)。以液体培养为参照标准,恒温扩增荧光检测法、痰涂片和GeneXpert检测的敏感度分别为58.94%(277/470)、52.77%(248/470)、80.43%(378/470);特异度分别为97.68%(1346/1378)、98.69%(1360/1378)、88.97%(1226/1378);一致率分别为87.82%(1623/1848)、87.01%(1608/1848)、86.80%(1604/1848),Kappa值分别为0.638、0.600、0.666。4种不同性状痰样本(黏液样痰、唾液样痰、干酪样痰和血样痰)中,除在唾液样痰中液体培养检出率最高[38.8%(59/152)]外,其余3种性状痰样(黏液样痰、干酪样痰和血样痰)均为GeneXpert检出率最高,分别为51.5%(308/598)、66.7%(28/42)和64.0%(16/25)。结论:恒温扩增荧光检测法检测痰样本中MTBC具有良好的检测特异度,该方法和痰涂片及GeneXpert与液体培养检测结果一致性均一般,临床可以根据实验室硬件条件及患者情况选择开展多种方法联合检测,以提高肺结核的病原学诊断率。
- 李静吴哲渊杨景卉杨丽媛王莉莉袁锋沈鑫江渊
- 关键词:核酸扩增技术